More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0015 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  100 
 
 
349 aa  703  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  94.84 
 
 
349 aa  666  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  86 
 
 
352 aa  600  1e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  86.51 
 
 
345 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  84.9 
 
 
351 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  84.15 
 
 
344 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  86.28 
 
 
351 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  69.3 
 
 
379 aa  460  1e-128  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  61.76 
 
 
341 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  60.23 
 
 
355 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  61.77 
 
 
365 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  61.76 
 
 
369 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  62.22 
 
 
338 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  61.01 
 
 
368 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  58.6 
 
 
368 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  61.01 
 
 
368 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  59.52 
 
 
357 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  56.93 
 
 
353 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  60 
 
 
327 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  60.44 
 
 
349 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  58.48 
 
 
351 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33124e-08 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  59.37 
 
 
327 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  60.25 
 
 
350 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  56.85 
 
 
348 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  56.69 
 
 
342 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  54.37 
 
 
370 aa  338  7e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  52.98 
 
 
360 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  53.97 
 
 
322 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  53.44 
 
 
333 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  50.76 
 
 
346 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  50.76 
 
 
346 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  50.76 
 
 
339 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  49.85 
 
 
373 aa  318  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  50.63 
 
 
337 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  49.85 
 
 
375 aa  315  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  52.05 
 
 
348 aa  314  2e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  48.2 
 
 
363 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  50.32 
 
 
365 aa  302  7e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  50.32 
 
 
326 aa  301  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  49.38 
 
 
338 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  51.91 
 
 
335 aa  301  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  48.09 
 
 
333 aa  299  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  49.21 
 
 
331 aa  298  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  49.52 
 
 
323 aa  298  8e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  51.67 
 
 
329 aa  297  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  51.71 
 
 
347 aa  296  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  46.96 
 
 
328 aa  294  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  46.5 
 
 
322 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  49.85 
 
 
348 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.25149e-09 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  50.32 
 
 
348 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  49.84 
 
 
346 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  50.32 
 
 
341 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  50.32 
 
 
341 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  50.8 
 
 
347 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  49.38 
 
 
356 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  48.89 
 
 
322 aa  292  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  49.07 
 
 
339 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  49.38 
 
 
355 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  50.8 
 
 
347 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  50.47 
 
 
347 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  49.38 
 
 
354 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  49.06 
 
 
354 aa  288  7e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  47.3 
 
 
319 aa  288  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  47.3 
 
 
319 aa  288  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  47.3 
 
 
319 aa  288  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  47.3 
 
 
319 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  47.3 
 
 
319 aa  288  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  49.06 
 
 
347 aa  288  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  46.25 
 
 
348 aa  288  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.31138e-09  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  49.06 
 
 
349 aa  288  9e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  48.12 
 
 
350 aa  288  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  49.03 
 
 
365 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  50.77 
 
 
374 aa  286  3e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  48.62 
 
 
349 aa  286  3e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  46.71 
 
 
315 aa  286  3e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  51.14 
 
 
319 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  49.53 
 
 
330 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  49.17 
 
 
351 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  47.3 
 
 
319 aa  285  6e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.88335e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  47.3 
 
 
319 aa  285  6e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  52.61 
 
 
339 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  47.45 
 
 
354 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  47.76 
 
 
319 aa  285  8e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  48.39 
 
 
367 aa  285  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.30716e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  46.67 
 
 
319 aa  285  1e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  48.12 
 
 
340 aa  285  1e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  49.2 
 
 
323 aa  284  1e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  51.75 
 
 
341 aa  285  1e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  48.22 
 
 
351 aa  284  2e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  49.2 
 
 
361 aa  284  2e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  46.98 
 
 
319 aa  284  2e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  49.35 
 
 
323 aa  284  2e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  49.17 
 
 
357 aa  283  3e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  49.35 
 
 
356 aa  283  3e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  49.17 
 
 
357 aa  283  3e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  47.58 
 
 
354 aa  283  4e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  45.91 
 
 
315 aa  283  5e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  45.91 
 
 
315 aa  283  5e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2163  PhoH family protein  48.77 
 
 
344 aa  282  6e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0763863  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  47.47 
 
 
328 aa  282  6e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>