More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2112 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  100 
 
 
354 aa  716    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1267  PhoH-like protein  92.05 
 
 
345 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  77.68 
 
 
348 aa  519  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3453  PhoH family protein  73.3 
 
 
380 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.127019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1658  PhoH family protein  76.23 
 
 
376 aa  508  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0789  PhoH family protein  78.55 
 
 
333 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0567134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  77.4 
 
 
354 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1156  PhoH family protein  76.85 
 
 
340 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3832  PhoH family protein  76.54 
 
 
329 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  72.75 
 
 
381 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7049  PhoH family protein  75.86 
 
 
393 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0707  PhoH family protein  73.21 
 
 
369 aa  484  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3387  PhoH family protein  74.47 
 
 
375 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  70.73 
 
 
349 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4627  PhoH family protein  70.76 
 
 
344 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1750  PhoH family protein  71.56 
 
 
376 aa  465  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224703  normal  0.417547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2206  PhoH family protein  70.73 
 
 
333 aa  465  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  72.84 
 
 
351 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2188  PhoH family protein  68.62 
 
 
345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  69.66 
 
 
357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12394  phoH-like protein phoH1 (phosphate starvation-inducible protein psiH)  72.43 
 
 
352 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3456  PhoH-like protein  69.69 
 
 
319 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745001  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11730  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  71.11 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1576  PhoH family protein  69.64 
 
 
355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0922563  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1912  PhoH family protein  69.06 
 
 
345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  69.66 
 
 
357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  68.67 
 
 
361 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2232  PhoH family protein  69.38 
 
 
362 aa  444  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00260346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3159  PhoH family protein  68.32 
 
 
343 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00307849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2706  PhoH family protein  70.38 
 
 
353 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13470  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  65.86 
 
 
353 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1969  PhoH family protein  67.81 
 
 
362 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000703344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1546  PhoH family protein  63.44 
 
 
350 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17250  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  60.19 
 
 
350 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.465991  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12340  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  61.3 
 
 
357 aa  368  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  52.9 
 
 
328 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  52.91 
 
 
361 aa  342  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1643  PhoH family protein  59.34 
 
 
318 aa  339  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00468401  hitchhiker  0.00249852 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12960  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  57.23 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  0.0890073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  53.18 
 
 
323 aa  335  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  53.23 
 
 
320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0593  PhoH-like protein  54.93 
 
 
333 aa  326  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.318782  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1985  PhoH family protein  52.73 
 
 
323 aa  322  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.460583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  50.81 
 
 
320 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  51.25 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1511  PhoH-like protein  56.57 
 
 
303 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  48.72 
 
 
324 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000842405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  50.76 
 
 
359 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2849  PhoH family protein  56.29 
 
 
338 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.489478  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  50.76 
 
 
359 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  53.12 
 
 
329 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  54.17 
 
 
323 aa  317  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  53.23 
 
 
354 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1249  PhoH family protein  66.81 
 
 
654 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  49.68 
 
 
348 aa  316  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2611  PhoH family protein  48.53 
 
 
351 aa  315  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  52.96 
 
 
333 aa  315  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  52.47 
 
 
339 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  50.82 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  52.7 
 
 
320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  53.23 
 
 
356 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  50.83 
 
 
319 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  50.17 
 
 
319 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  50.17 
 
 
319 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  50.17 
 
 
319 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  50.17 
 
 
319 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  49.03 
 
 
319 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  50.17 
 
 
319 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  53.07 
 
 
359 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  50.17 
 
 
319 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  51.12 
 
 
319 aa  309  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  53.07 
 
 
340 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  50 
 
 
320 aa  308  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  49.35 
 
 
319 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  50.17 
 
 
319 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  50.17 
 
 
319 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  49.71 
 
 
352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  52.6 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  50.62 
 
 
332 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  50.3 
 
 
340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1566  PhoH-like protein  48.56 
 
 
322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.359583  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0329  PhoH family protein  50.49 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  50.95 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  50.84 
 
 
335 aa  302  5.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1775  phosphate starvation-induced protein  49.84 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.901151  normal  0.888471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2163  PhoH family protein  50.31 
 
 
344 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0763863  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  47.77 
 
 
348 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  50.95 
 
 
332 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2048  PhoH family protein  49.68 
 
 
323 aa  301  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  49.85 
 
 
340 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  49.21 
 
 
318 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  49.03 
 
 
328 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0777  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  50.84 
 
 
330 aa  300  3e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  52.53 
 
 
331 aa  298  9e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  50.32 
 
 
332 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  51.83 
 
 
334 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1145  PhoH family protein  50.49 
 
 
317 aa  296  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  48.71 
 
 
345 aa  295  7e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1415  PhoH family protein  50.33 
 
 
332 aa  295  7e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2769  PhoH family protein  51.57 
 
 
320 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.405209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>