More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3528 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  100 
 
 
340 aa  692    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  71.34 
 
 
339 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  68.22 
 
 
346 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  68.55 
 
 
319 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  62.03 
 
 
357 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  66.03 
 
 
325 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  61.67 
 
 
359 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0650  PhoH-like protein  65.61 
 
 
328 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  65.03 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  65.03 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  65.03 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  61.85 
 
 
362 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  64 
 
 
348 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  62.95 
 
 
330 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  64.62 
 
 
348 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  62.42 
 
 
352 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  62.76 
 
 
348 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  62.35 
 
 
354 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0590  PhoH family protein  61.61 
 
 
358 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.178371  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  62.42 
 
 
352 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  62.05 
 
 
354 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  62.42 
 
 
352 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  62.42 
 
 
352 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  62.05 
 
 
354 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  62.27 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  64.76 
 
 
341 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  65.7 
 
 
330 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  64.01 
 
 
331 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  60.77 
 
 
374 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  63.99 
 
 
338 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  62.01 
 
 
335 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  61.69 
 
 
335 aa  374  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  61.86 
 
 
323 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  61.36 
 
 
316 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  60 
 
 
337 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  60.38 
 
 
316 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  60.19 
 
 
345 aa  363  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  60.39 
 
 
316 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  56.66 
 
 
330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  59.09 
 
 
338 aa  352  5e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  56.97 
 
 
350 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  55.69 
 
 
340 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  57.19 
 
 
337 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  55.7 
 
 
348 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  56.05 
 
 
340 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  55.45 
 
 
340 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  55.59 
 
 
340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  55.52 
 
 
334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  57.59 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  57.51 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  56 
 
 
332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  54.18 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  57.59 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  57.59 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  56.21 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  52.54 
 
 
365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  55.79 
 
 
332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  56.21 
 
 
332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  51.03 
 
 
359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  56.33 
 
 
351 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  56.96 
 
 
346 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  54.46 
 
 
327 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  54.63 
 
 
341 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  54.46 
 
 
327 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  53.63 
 
 
323 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  52.28 
 
 
343 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  56.65 
 
 
359 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  56.65 
 
 
359 aa  332  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  56.65 
 
 
359 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  56.65 
 
 
348 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  56.65 
 
 
359 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  56.65 
 
 
348 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  56.65 
 
 
348 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  56.65 
 
 
348 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  56.65 
 
 
348 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  56.65 
 
 
346 aa  332  6e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  56.65 
 
 
346 aa  332  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  56.65 
 
 
346 aa  332  6e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  57.1 
 
 
352 aa  332  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  56.33 
 
 
352 aa  332  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  56.65 
 
 
346 aa  332  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  53.63 
 
 
323 aa  331  9e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  56.01 
 
 
348 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  56.65 
 
 
350 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  56.65 
 
 
351 aa  329  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  53.07 
 
 
342 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  55.06 
 
 
336 aa  328  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  55.59 
 
 
367 aa  328  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  56.09 
 
 
328 aa  328  8e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  48.7 
 
 
368 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  54.11 
 
 
322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  54.97 
 
 
365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  55.59 
 
 
370 aa  325  6e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  53.9 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  53.9 
 
 
327 aa  325  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2291  PhoH family protein  55.86 
 
 
334 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  55.28 
 
 
365 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2138  PhoH family protein  54.95 
 
 
331 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888079  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  54.63 
 
 
356 aa  322  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  53.85 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>