More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0738 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  100 
 
 		 338 aa  688    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  80.66 
 
 		 345 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  80.72 
 
 		 337 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  78.91 
 
 		 316 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  79.22 
 
 		 335 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  79.22 
 
 		 335 aa  494  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  78.83 
 
 		 316 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  77.42 
 
 		 323 aa  485  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  76.19 
 
 		 316 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  69.84 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  63.29 
 
 		 374 aa  411  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  62.66 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  62.01 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  63.33 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  58.17 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  57.71 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  62.18 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  59.76 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  59.46 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  62.34 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  58 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  59.16 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  59.46 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  59.16 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  59.46 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  58.16 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  58.16 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  57.82 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  58.16 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  61.02 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  57.82 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  57.82 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  61.09 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  58.16 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  61.97 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0650  PhoH-like protein  60.6 
 
 		 328 aa  364  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0590  PhoH family protein  56.85 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.178371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  58.72 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  57.61 
 
 		 332 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  57.61 
 
 		 332 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  59.09 
 
 		 340 aa  352  7e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  57.28 
 
 		 332 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  55.91 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  56.63 
 
 		 332 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  54.97 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  56.69 
 
 		 328 aa  348  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  58.17 
 
 		 328 aa  345  8.999999999999999e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  56.73 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  58.77 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  57.65 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  52.68 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  52.77 
 
 		 340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  56.49 
 
 		 334 aa  342  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  55.41 
 
 		 322 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  54.08 
 
 		 340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  56.49 
 
 		 340 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  56.49 
 
 		 340 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  59.74 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  58.06 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  57.74 
 
 		 327 aa  335  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  56.54 
 
 		 348 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  56.68 
 
 		 350 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2335  PhoH-like protein  57.19 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  55.48 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  55.38 
 
 		 351 aa  328  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  51.43 
 
 		 342 aa  328  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  55.16 
 
 		 348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  55.16 
 
 		 341 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  55.16 
 
 		 341 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  54.6 
 
 		 348 aa  326  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  54.6 
 
 		 350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  55.74 
 
 		 328 aa  325  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  55.91 
 
 		 347 aa  325  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  54.67 
 
 		 340 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  56.91 
 
 		 370 aa  324  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  54.67 
 
 		 327 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  53.97 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  54.18 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  55.45 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  53.8 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  51.32 
 
 		 359 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  55.38 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  53.75 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  53.75 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  53.75 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  53.75 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  53.75 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  53.75 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  53.75 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  55.38 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  53.75 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  53.75 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  52.55 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  53.4 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  54.29 
 
 		 351 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  54.01 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  54.01 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  54.01 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  52.55 
 
 		 354 aa  322  8e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  56.09 
 
 		 365 aa  322  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>