More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3006 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  730    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  100 
 
 		 357 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  100 
 
 		 357 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  92.31 
 
 		 351 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  89.21 
 
 		 352 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  86.86 
 
 		 350 aa  611  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  85.96 
 
 		 351 aa  611  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  88.63 
 
 		 352 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  87.03 
 
 		 359 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  87.03 
 
 		 359 aa  608  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  87.03 
 
 		 359 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  87.03 
 
 		 359 aa  608  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  87.46 
 
 		 346 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  87.46 
 
 		 346 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  87.46 
 
 		 346 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  87.46 
 
 		 346 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  87.17 
 
 		 346 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  85.67 
 
 		 348 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  85.67 
 
 		 348 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  85.67 
 
 		 348 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  85.67 
 
 		 348 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  85.67 
 
 		 348 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  84.24 
 
 		 348 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  79.64 
 
 		 365 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  79.94 
 
 		 365 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  77.03 
 
 		 356 aa  518  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  78.48 
 
 		 367 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  74.27 
 
 		 370 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  67.61 
 
 		 365 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2207  PhoH-like protein  73.39 
 
 		 345 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.935668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  72.75 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  74.16 
 
 		 356 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  70.66 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  70.49 
 
 		 347 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  71.72 
 
 		 341 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  70.03 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  70.9 
 
 		 349 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  71.72 
 
 		 341 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  70.37 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  72.75 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  69.6 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  68.97 
 
 		 346 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  74.23 
 
 		 355 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  73.93 
 
 		 347 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  72 
 
 		 347 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  68.66 
 
 		 342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  66.67 
 
 		 368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0345  PhoH-like ATP-binding protein  64.02 
 
 		 370 aa  441  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  61.75 
 
 		 341 aa  411  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  62.12 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  62.5 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  62.97 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  61.82 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  61.93 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  61.8 
 
 		 332 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  62.11 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  62.11 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  61.64 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  62.11 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  61.27 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  61.27 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  61.13 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  60.68 
 
 		 328 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2291  PhoH family protein  62.04 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  61.27 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  60.13 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  56.6 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  59.69 
 
 		 328 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  57.41 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  57.41 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  58.04 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  57.62 
 
 		 322 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  59.81 
 
 		 337 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  55.96 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  55.66 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2335  PhoH-like protein  60.69 
 
 		 364 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  56.43 
 
 		 319 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1970  PhoH family protein  50.82 
 
 		 379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0372063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  55.23 
 
 		 339 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  57.59 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  54.34 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  56.4 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  56.79 
 
 		 346 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  54.97 
 
 		 331 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  57.91 
 
 		 316 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  56.1 
 
 		 330 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  57.63 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  55.83 
 
 		 337 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0650  PhoH-like protein  55.66 
 
 		 328 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  54.89 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  57.1 
 
 		 338 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  56.73 
 
 		 323 aa  342  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  53.91 
 
 		 348 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  54.89 
 
 		 335 aa  342  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0627  putative PhoH-like protein, ATPase  49.58 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  55.91 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  56.27 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  53.62 
 
 		 348 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  52.94 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  54.83 
 
 		 316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.579724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>