149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1667 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  100 
 
 
392 aa  803    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  59.01 
 
 
388 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  58.1 
 
 
389 aa  471  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  59.07 
 
 
390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  58.55 
 
 
389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  56.8 
 
 
397 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  57.11 
 
 
397 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  55.3 
 
 
394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  56.48 
 
 
396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  57.73 
 
 
390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  56.07 
 
 
388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  57.99 
 
 
390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  55.04 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  55.3 
 
 
397 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  52.69 
 
 
394 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  54.83 
 
 
390 aa  431  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  54.57 
 
 
393 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  52.94 
 
 
395 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  55.67 
 
 
396 aa  428  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  52.94 
 
 
394 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  52.94 
 
 
394 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  52.43 
 
 
394 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  52.43 
 
 
394 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  52.43 
 
 
394 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  52.43 
 
 
394 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  52.43 
 
 
394 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  52.43 
 
 
394 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  52.41 
 
 
420 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  51.92 
 
 
390 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  52.43 
 
 
394 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  53.52 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  57.18 
 
 
349 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  54.17 
 
 
392 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  51.68 
 
 
392 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  48.84 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  52.3 
 
 
390 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  48.85 
 
 
391 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  50.93 
 
 
389 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  49.48 
 
 
388 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  50 
 
 
392 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  50 
 
 
392 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  50 
 
 
385 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  48.97 
 
 
391 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  49.23 
 
 
388 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  48.6 
 
 
392 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  47.04 
 
 
396 aa  368  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  48.17 
 
 
381 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  47.38 
 
 
386 aa  355  5e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  45.71 
 
 
397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  49.87 
 
 
392 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  48.4 
 
 
407 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  47.28 
 
 
401 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  46.52 
 
 
396 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  46.52 
 
 
396 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  47.41 
 
 
407 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  46.67 
 
 
384 aa  333  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  45.01 
 
 
407 aa  325  7e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  45.01 
 
 
407 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  45.01 
 
 
407 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  45.5 
 
 
407 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  45.02 
 
 
403 aa  323  4e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  46.42 
 
 
407 aa  322  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  45.83 
 
 
407 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  44.72 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  45.75 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  43.98 
 
 
406 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  45.23 
 
 
407 aa  319  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  44.53 
 
 
403 aa  318  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  44.53 
 
 
403 aa  318  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  45.43 
 
 
404 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  45.43 
 
 
404 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  45.43 
 
 
404 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  45.43 
 
 
404 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  43.95 
 
 
404 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  42.05 
 
 
411 aa  317  3e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  44.01 
 
 
409 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  43.98 
 
 
406 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  43.98 
 
 
406 aa  315  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  44.33 
 
 
405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  45.04 
 
 
406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  43.95 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  44.94 
 
 
404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  44.12 
 
 
406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  43.98 
 
 
406 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  44.04 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  44.28 
 
 
405 aa  310  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  41.81 
 
 
415 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  44.04 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  44.04 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  43.8 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  44.04 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  44.04 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  44.04 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  44.04 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  43.8 
 
 
407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  44.04 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  45.11 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  45.11 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  45.11 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  45.11 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>