64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2421 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  100 
 
 		 439 aa  878    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  41.9 
 
 		 534 aa  272  9e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  41.1 
 
 		 542 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  43.81 
 
 		 617 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  42.39 
 
 		 533 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  41.42 
 
 		 586 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  42.02 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  43.13 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  41.76 
 
 		 487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  34.93 
 
 		 497 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  32.4 
 
 		 478 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  34.08 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  35.27 
 
 		 771 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  34.58 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  36.49 
 
 		 544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  31.35 
 
 		 478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  36.58 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  31.38 
 
 		 665 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  35.15 
 
 		 759 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  31.87 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  31.22 
 
 		 495 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  32.44 
 
 		 639 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  31.49 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  31.99 
 
 		 619 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  30.07 
 
 		 899 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.42 
 
 		 698 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  31.33 
 
 		 364 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  31.53 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  31.63 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  31.63 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  31.63 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  30.94 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27 
 
 		 552 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  26.89 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  29.9 
 
 		 346 aa  97.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  24.93 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  24.91 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  26.62 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  25.22 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  26.62 
 
 		 587 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.74 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  26.3 
 
 		 811 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  26.92 
 
 		 1132 aa  73.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  25.41 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  25.09 
 
 		 666 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  27.66 
 
 		 1160 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  25.42 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  25.42 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  25.42 
 
 		 475 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.83 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  28.11 
 
 		 926 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  26.71 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  25.42 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  22.83 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  26.53 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1519 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  26.53 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  26.53 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25.25 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  26.32 
 
 		 968 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  25.77 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  24.24 
 
 		 544 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.37 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>