More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2088 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 484 aa  939    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.06 
 
 		 482 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.51 
 
 		 482 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.44 
 
 		 712 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.44 
 
 		 475 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.36 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.23 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  43.83 
 
 		 720 aa  315  8e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  41.09 
 
 		 704 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.65 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 		 722 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  42.74 
 
 		 505 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.32 
 
 		 472 aa  302  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.66 
 
 		 472 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.47 
 
 		 746 aa  299  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  39.44 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  39.58 
 
 		 510 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  38.17 
 
 		 516 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.08 
 
 		 482 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  41.58 
 
 		 510 aa  293  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  38.43 
 
 		 713 aa  292  9e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  39.17 
 
 		 717 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  39.87 
 
 		 738 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  37.41 
 
 		 714 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  39.43 
 
 		 716 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.17 
 
 		 717 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.74 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  36.71 
 
 		 714 aa  286  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  38.82 
 
 		 716 aa  285  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  43.13 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  41.79 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.92 
 
 		 722 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  35.96 
 
 		 546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.6 
 
 		 474 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  40.88 
 
 		 507 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.33 
 
 		 722 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  36.21 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  38.43 
 
 		 508 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.33 
 
 		 713 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  38.54 
 
 		 507 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.83 
 
 		 705 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40 
 
 		 717 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  39.92 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  40.17 
 
 		 548 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  39.13 
 
 		 470 aa  267  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.63 
 
 		 475 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.55 
 
 		 480 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.65 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.23 
 
 		 488 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  37.42 
 
 		 546 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  35.66 
 
 		 509 aa  262  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.2 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  40.88 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  38.36 
 
 		 472 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  40.57 
 
 		 550 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  38.46 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  39.65 
 
 		 557 aa  256  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.22 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.49 
 
 		 470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.76 
 
 		 508 aa  253  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  32.17 
 
 		 546 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.95 
 
 		 494 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  37.23 
 
 		 467 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  36.6 
 
 		 469 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  32.17 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.15 
 
 		 515 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.08 
 
 		 461 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  38.15 
 
 		 484 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  36.8 
 
 		 503 aa  249  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  32.22 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  37.97 
 
 		 547 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  37.97 
 
 		 547 aa  246  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  32.22 
 
 		 499 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  37.07 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  36.6 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  35.73 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.01 
 
 		 495 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.1 
 
 		 489 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  36.34 
 
 		 468 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  33.75 
 
 		 532 aa  239  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  35.43 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  37.63 
 
 		 745 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 		 465 aa  236  6e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.78 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.56 
 
 		 458 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  36.99 
 
 		 767 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.25 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.63 
 
 		 459 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  37.58 
 
 		 561 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  37.02 
 
 		 561 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  38.26 
 
 		 562 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  37.39 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  37.39 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  37.39 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  37.39 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.41 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.54 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.42 
 
 		 473 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  37.17 
 
 		 561 aa  230  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>