More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0062 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
306 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  45.27 
 
 
317 aa  221  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  46.69 
 
 
316 aa  216  3e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  45.25 
 
 
333 aa  215  6e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  42.47 
 
 
303 aa  197  2e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  42.95 
 
 
311 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  45.82 
 
 
303 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  45.39 
 
 
332 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  42.53 
 
 
317 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  44.52 
 
 
317 aa  190  3e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  42.43 
 
 
317 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  42.43 
 
 
317 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  42.39 
 
 
346 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  2.64187e-05 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  39.87 
 
 
329 aa  182  9e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  39.55 
 
 
334 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 
300 aa  172  6e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  41.25 
 
 
316 aa  172  8e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  40.33 
 
 
326 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  42.12 
 
 
309 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  38.61 
 
 
306 aa  162  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  40.51 
 
 
335 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  41.75 
 
 
328 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  37.74 
 
 
306 aa  155  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  40.33 
 
 
309 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  41.53 
 
 
310 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  39.06 
 
 
316 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  36.98 
 
 
306 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  38.02 
 
 
321 aa  145  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  38.69 
 
 
320 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  35.26 
 
 
308 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  34.94 
 
 
308 aa  140  2e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  35.95 
 
 
311 aa  140  2e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  34.62 
 
 
308 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  35.31 
 
 
308 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  34.94 
 
 
310 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  36.91 
 
 
322 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  37.58 
 
 
326 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  38.1 
 
 
320 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  35.02 
 
 
308 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  36.48 
 
 
312 aa  137  3e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  35.69 
 
 
308 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  35.39 
 
 
309 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  28.3 
 
 
315 aa  132  8e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  42.79 
 
 
251 aa  131  2e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  35.05 
 
 
306 aa  129  5e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  34.07 
 
 
308 aa  129  5e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  33.97 
 
 
309 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  33.12 
 
 
317 aa  128  1e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  35.41 
 
 
307 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
319 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  33.44 
 
 
306 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  36.74 
 
 
306 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  35.13 
 
 
308 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  36.74 
 
 
306 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  34.39 
 
 
312 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  35.51 
 
 
310 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  34.73 
 
 
312 aa  117  2e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 
313 aa  117  2e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  34.31 
 
 
298 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  35.83 
 
 
310 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 
315 aa  116  4e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  34.86 
 
 
319 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  37.63 
 
 
315 aa  115  8e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
306 aa  115  1e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  33.23 
 
 
312 aa  115  1e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  34.24 
 
 
338 aa  114  2e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  34.06 
 
 
321 aa  110  4e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  31.03 
 
 
323 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 
319 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  35.31 
 
 
312 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  34.39 
 
 
314 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  35.2 
 
 
315 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  32.39 
 
 
322 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.56 
 
 
323 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  32.81 
 
 
312 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 
316 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  35.11 
 
 
319 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.1 
 
 
323 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  33.65 
 
 
323 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  34.22 
 
 
311 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 
315 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 
315 aa  99.8  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  33.72 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  33.46 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  33.08 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  32.71 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25.88 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  28.39 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.72 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.41 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.72 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.72 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.76 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  32.01 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  28.39 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.3 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  30.68 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  33.58 
 
 
317 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>