More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2227 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  57.49 
 
 		 167 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  56.57 
 
 		 173 aa  184  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  55.9 
 
 		 157 aa  183  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  59.35 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  55.29 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  61.04 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  54.76 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  56.36 
 
 		 151 aa  176  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  50.85 
 
 		 190 aa  174  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  56.13 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  53.14 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  55.84 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  51.61 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  53.01 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  56.62 
 
 		 196 aa  170  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  60.14 
 
 		 236 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  60.14 
 
 		 234 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  60.14 
 
 		 234 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  54.25 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  60.14 
 
 		 236 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  65.14 
 
 		 200 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  60.14 
 
 		 234 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  50.62 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  50 
 
 		 188 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  53.29 
 
 		 168 aa  167  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  51.63 
 
 		 149 aa  166  8e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  65.22 
 
 		 238 aa  166  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  53.49 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  57.55 
 
 		 222 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  63.48 
 
 		 231 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  54.94 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  49.72 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  52.94 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  65.18 
 
 		 236 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  44.79 
 
 		 214 aa  163  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  50.56 
 
 		 177 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  52.41 
 
 		 163 aa  163  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  50.56 
 
 		 177 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  66.07 
 
 		 234 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  50 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  50 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  53.16 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  50.93 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  49.34 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  50.93 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  53.16 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  65.18 
 
 		 236 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  54.25 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  65.18 
 
 		 235 aa  161  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  52.63 
 
 		 171 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  62.93 
 
 		 242 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  66.37 
 
 		 130 aa  159  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  50 
 
 		 185 aa  159  9e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  52.6 
 
 		 154 aa  159  9e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  62.81 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  62.81 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  49.7 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  62.81 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  48.95 
 
 		 180 aa  158  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  62.81 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  65.49 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  49.13 
 
 		 173 aa  158  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  62.81 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  65.49 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  62.81 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  62.81 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  67.59 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  62.81 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  46.2 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  67.57 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  63.72 
 
 		 225 aa  157  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  63.72 
 
 		 220 aa  157  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  65.49 
 
 		 181 aa  157  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  47.34 
 
 		 188 aa  157  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  61.48 
 
 		 178 aa  156  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  50 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  51.74 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  63.39 
 
 		 233 aa  155  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  64.86 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  66.37 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  66.37 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  67.59 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  66.37 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  67.59 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  50 
 
 		 222 aa  154  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  51.97 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  49.1 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  50.3 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  61.06 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  48.3 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  48.59 
 
 		 177 aa  153  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>