33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0143 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 
681 aa  1389    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  40.08 
 
 
708 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  36.5 
 
 
676 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  28.06 
 
 
591 aa  151  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  25.3 
 
 
654 aa  132  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.42 
 
 
672 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  35.02 
 
 
494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  24.59 
 
 
654 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.83 
 
 
614 aa  94.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  25.83 
 
 
697 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  24.13 
 
 
670 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  26.8 
 
 
771 aa  74.3  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  30.58 
 
 
641 aa  63.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.85 
 
 
582 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3380  hypothetical protein  36.92 
 
 
83 aa  54.7  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0641471  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  35.63 
 
 
368 aa  50.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.9 
 
 
607 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.17 
 
 
548 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  31.82 
 
 
591 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  44.9 
 
 
597 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  20.34 
 
 
666 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  30.91 
 
 
626 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.55 
 
 
589 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.8 
 
 
595 aa  45.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.36 
 
 
603 aa  45.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.07 
 
 
642 aa  45.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  20.57 
 
 
688 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.93 
 
 
591 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.07 
 
 
626 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.93 
 
 
613 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  33.61 
 
 
454 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  29.66 
 
 
427 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  43.18 
 
 
496 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>