More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3045 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  43.26 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  33.33 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 528 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 321 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.78 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 477 aa  92.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  31.63 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  35.19 
 
 		 310 aa  89  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 322 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 841 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 313 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  33.62 
 
 		 792 aa  85.9  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.26 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  38.98 
 
 		 1157 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  39.22 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  29.77 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  39.22 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  41.24 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 924 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  40.21 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  40.21 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  27.9 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  38.83 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  42.16 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  30.56 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 1061 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  41.18 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  41.18 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  41.18 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  41.18 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  41.18 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  27.13 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  29.52 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  41.18 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 785 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 884 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.3 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30.89 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.18 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.18 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.18 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.18 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30.89 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.18 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.18 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 		 841 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  36.75 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  28.85 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>