More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0237 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  89.64 
 
 		 307 aa  528  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  81.33 
 
 		 316 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  81.9 
 
 		 315 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  78.77 
 
 		 324 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  80.32 
 
 		 310 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  67.09 
 
 		 313 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  69.4 
 
 		 317 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  63.32 
 
 		 320 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  62.23 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  63.96 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  64.24 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  63 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  62.67 
 
 		 300 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  63.64 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  62.58 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  58.02 
 
 		 325 aa  352  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  58.02 
 
 		 325 aa  352  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  65.37 
 
 		 287 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  59.36 
 
 		 343 aa  351  1e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  58.13 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  59.42 
 
 		 298 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  58.27 
 
 		 279 aa  319  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  60.51 
 
 		 279 aa  315  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  60.46 
 
 		 292 aa  315  8e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  56.82 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  57.64 
 
 		 316 aa  310  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  57.19 
 
 		 283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  56.32 
 
 		 285 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  56.32 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  56.32 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  56.32 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  56.32 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  56.32 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  56.32 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  56.32 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  56.18 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  55.76 
 
 		 285 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  55.76 
 
 		 285 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  54.87 
 
 		 285 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  54.87 
 
 		 296 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  54.68 
 
 		 285 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  54.51 
 
 		 285 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  55.04 
 
 		 285 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  55.04 
 
 		 285 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  55.04 
 
 		 285 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  55.04 
 
 		 285 aa  298  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  55.48 
 
 		 286 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  54.77 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  55.12 
 
 		 286 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  54.96 
 
 		 286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  54.31 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  53.6 
 
 		 280 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  54.55 
 
 		 285 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  50.54 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  52.36 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  52.36 
 
 		 280 aa  275  9e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  56.68 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  50.71 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  54.64 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  50.9 
 
 		 287 aa  268  8e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  53.74 
 
 		 282 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  50.74 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  50.75 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  53.21 
 
 		 280 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  46.57 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  52.86 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  53.85 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  51.64 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  50.71 
 
 		 294 aa  251  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  49.62 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  50.94 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  51.93 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  53.94 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  47.89 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  51.93 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  48.94 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  52.11 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  46.24 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  53.03 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  45.77 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  52.27 
 
 		 287 aa  245  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  45.42 
 
 		 285 aa  244  9e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  44.72 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  51.96 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  44.72 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  53.76 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  46.45 
 
 		 284 aa  242  7e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  44.25 
 
 		 288 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  46.55 
 
 		 285 aa  238  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  45.2 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  48.68 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  48.19 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  47.7 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  44.64 
 
 		 279 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  48.79 
 
 		 282 aa  231  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  44.33 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  44.8 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1529  peptidase M48 Ste24p  49.47 
 
 		 281 aa  231  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  44.73 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>