71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2971 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 370 aa  721    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  63.91 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  53.9 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  46.35 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  46.3 
 
 		 329 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  43.64 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  41.84 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  42.65 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  47.27 
 
 		 342 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  42.81 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  35.79 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  38.41 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  42.39 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  41.5 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  43.91 
 
 		 326 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  43.55 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.43 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  40.62 
 
 		 328 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.45 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  38.77 
 
 		 301 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.36 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  41.37 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  39.68 
 
 		 370 aa  152  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  34.74 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  38.13 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  41.29 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  40.53 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  41.29 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  39.64 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  39.64 
 
 		 318 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.94 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  37 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  38.46 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  38.12 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 		 304 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  37.68 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  31.76 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  35.97 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  26.96 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  24.38 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  25.37 
 
 		 622 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  24.7 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  33.57 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  28.02 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  29.55 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  29.63 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  27.82 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  29.38 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  28.49 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  26.04 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  23.96 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  27.86 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  32.41 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  29.6 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  27.82 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  26.3 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  28.02 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  26.84 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  32.81 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  27.49 
 
 		 373 aa  47  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  27.15 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  28.64 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  27.92 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  26.11 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  29.05 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  25.58 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  28.25 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  23.81 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  23.33 
 
 		 327 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>