55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0073 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 		 286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  54.81 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  49.1 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  41.51 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  38.13 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  38.63 
 
 		 249 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  35.42 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  34.68 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  34.75 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  35.23 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  35.47 
 
 		 521 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  33.08 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  34.6 
 
 		 556 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  34.48 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  34.04 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  30.93 
 
 		 192 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  33.46 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  32.06 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  30.92 
 
 		 368 aa  106  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  31.15 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  28.03 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  28.78 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  32.05 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  29.34 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.78 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  28 
 
 		 236 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.08 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  32.77 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.19 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.19 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  28.39 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  27.54 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  38.64 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  37.5 
 
 		 187 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  36.36 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  29.27 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  41.38 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  31.9 
 
 		 197 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  39.56 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  32.32 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.66 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.66 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.66 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.66 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.63 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.05 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.05 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  27.44 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  30.16 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  27.44 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  35.85 
 
 		 205 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  29.27 
 
 		 210 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  40.7 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  39.53 
 
 		 207 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  35.71 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>