More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0839 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  56.03 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  54.23 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  53.52 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  53.52 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  53.52 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  57.55 
 
 		 158 aa  153  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  55.8 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  53.9 
 
 		 157 aa  151  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 166 aa  148  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  56.52 
 
 		 162 aa  147  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  55.15 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_002978  WD0066  30S ribosomal protein S9  53.52 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  55.73 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 162 aa  143  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  53.15 
 
 		 158 aa  143  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  50.7 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 162 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  51.02 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  53.15 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  55.3 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  55.3 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 161 aa  140  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 161 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  55.3 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  55.3 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  51.03 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  52.27 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44376  Putative mitochondrial ribosomal protein S9  52.94 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272268  normal  0.0615746 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  52.27 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  56.43 
 
 		 173 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  50.4 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  52 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  54.69 
 
 		 170 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0388  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  51.56 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 130 aa  121  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2043  ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2878  ribosomal protein S9  49.3 
 
 		 180 aa  120  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  54.84 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>