65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5924 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  715    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  78.11 
 
 
365 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  78.11 
 
 
365 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  77.57 
 
 
365 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  74.86 
 
 
364 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  69.09 
 
 
199 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  69.09 
 
 
201 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  69.09 
 
 
201 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  63.79 
 
 
234 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  63.79 
 
 
232 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  58.77 
 
 
220 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  51.63 
 
 
372 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  51.63 
 
 
372 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  51.21 
 
 
372 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  52.97 
 
 
378 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  47.26 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  50.26 
 
 
348 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  49.74 
 
 
348 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  49.74 
 
 
348 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  52.66 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  49.68 
 
 
216 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  48.21 
 
 
348 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  48.07 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  58.12 
 
 
256 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  53.72 
 
 
251 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  52.89 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  53.72 
 
 
251 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  53.72 
 
 
251 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  50.24 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  51.22 
 
 
220 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  50.83 
 
 
322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  46.04 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  46.04 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  50 
 
 
437 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  50 
 
 
437 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  48.88 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  45.38 
 
 
682 aa  90.1  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  42.98 
 
 
171 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  42.98 
 
 
171 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  35.71 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  32.48 
 
 
294 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  30.77 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  26.36 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  34.21 
 
 
317 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  34.65 
 
 
324 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  38 
 
 
1048 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  30.7 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  34.91 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 
767 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  29.73 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  25.88 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  37.5 
 
 
364 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  28.89 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  24.71 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  29.93 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  31.4 
 
 
227 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  25 
 
 
366 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  24.7 
 
 
338 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  29.27 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.33 
 
 
288 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  34.44 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  33.91 
 
 
526 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  23.74 
 
 
330 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  30.25 
 
 
472 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>