More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4021 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  100 
 
 		 125 aa  260  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  98.4 
 
 		 125 aa  257  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  80.49 
 
 		 124 aa  213  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  79.67 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  79.67 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  78.86 
 
 		 124 aa  207  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  63.11 
 
 		 122 aa  167  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  60 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  56.56 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  58.26 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  55.28 
 
 		 123 aa  150  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  51.2 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  54.4 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  60.33 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  56.03 
 
 		 120 aa  148  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  54.1 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  56.67 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  55 
 
 		 120 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  54.17 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  48.8 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  53.78 
 
 		 120 aa  146  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  52.03 
 
 		 154 aa  146  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  60.55 
 
 		 122 aa  146  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  56.03 
 
 		 137 aa  146  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  51.61 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  54.95 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  52.07 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  54.24 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  58.93 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  48.36 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  54.78 
 
 		 117 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  51.24 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  58.68 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  58.68 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  49.59 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  58.68 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  49.59 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  48 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  49.59 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  52.59 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  54.46 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  47.54 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  53.6 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  48.72 
 
 		 121 aa  135  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  50 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  58.33 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  51.79 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  54.13 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  56.3 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  59.26 
 
 		 123 aa  131  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  47.83 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  54.17 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  43.9 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  43.9 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  46.15 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  49.14 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  42.15 
 
 		 123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  50 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  48 
 
 		 123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  43.44 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  42.73 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  46.08 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  42.86 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  33.05 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  33.05 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  39.64 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  43 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  32.71 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  36.04 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  32.71 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  42.57 
 
 		 170 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  43.53 
 
 		 178 aa  89.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  41.58 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  41.58 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  46.91 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  41.18 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  35.35 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  44.44 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  44.44 
 
 		 140 aa  83.6  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  44.44 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  42.39 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  41.67 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  42 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  42 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  47.25 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  44.57 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  38 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  37.62 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  38.61 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  46.81 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  40 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  45.45 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  43.21 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  48.45 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  45.74 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  42.53 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  42.53 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  39.05 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  44.76 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  37.23 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>