56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3464 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  524  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  84.53 
 
 
264 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  77.99 
 
 
268 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  77.61 
 
 
268 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  77.61 
 
 
268 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  40.93 
 
 
262 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  40.29 
 
 
268 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  40.23 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  39.61 
 
 
280 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  42.97 
 
 
276 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  38.7 
 
 
269 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  37.73 
 
 
263 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  39.62 
 
 
276 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  36.3 
 
 
256 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  36.43 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  37.55 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  36.9 
 
 
258 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  34.85 
 
 
254 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  34.13 
 
 
267 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  34.78 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  35.25 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  32.72 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  36.61 
 
 
267 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  33.07 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  33.07 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  33.86 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  36.47 
 
 
269 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  32.31 
 
 
270 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  29.66 
 
 
271 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  30.38 
 
 
257 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  29.59 
 
 
271 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  29.5 
 
 
257 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  28.79 
 
 
257 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  31.73 
 
 
263 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  30.19 
 
 
258 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  27.39 
 
 
265 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  31.85 
 
 
288 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  29.02 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  27.45 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  31.11 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  29.92 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  31.78 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  28.85 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  32.87 
 
 
276 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  32.87 
 
 
276 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  32.87 
 
 
276 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  26.97 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  24.34 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  26.64 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  26.67 
 
 
270 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  26.3 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  26.3 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  28.79 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>