29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0722 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  100 
 
 
438 aa  884  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  54.66 
 
 
475 aa  496  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  68.95 
 
 
517 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  46.92 
 
 
417 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  47.7 
 
 
415 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  44.06 
 
 
408 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  1.25656e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  44.92 
 
 
434 aa  354  2e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  63.16 
 
 
443 aa  354  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  46.17 
 
 
440 aa  353  3e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  43.1 
 
 
477 aa  351  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  60.28 
 
 
464 aa  351  1e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  63.2 
 
 
407 aa  348  2e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  64.66 
 
 
438 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  64.29 
 
 
438 aa  346  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  64.53 
 
 
439 aa  345  7e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  61.42 
 
 
491 aa  334  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  41.48 
 
 
452 aa  332  7e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  57.51 
 
 
505 aa  322  8e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  43.65 
 
 
426 aa  322  1e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  40.32 
 
 
405 aa  315  7e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  42.92 
 
 
413 aa  315  1e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  5.61406e-10  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  40.92 
 
 
407 aa  313  4e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  57.89 
 
 
461 aa  313  4e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  42.49 
 
 
402 aa  306  4e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  55.64 
 
 
537 aa  293  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  39.5 
 
 
405 aa  286  4e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  32.3 
 
 
380 aa  194  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  35.63 
 
 
403 aa  68.9  2e-10  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  36.59 
 
 
600 aa  44.7  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>