More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0711 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  45.99 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  45.59 
 
 		 138 aa  129  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  40.15 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  39.42 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  49.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  49.52 
 
 		 257 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  46.23 
 
 		 259 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  43.27 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  51 
 
 		 115 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  40.15 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  37.31 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  44.23 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  50.5 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  47.06 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  46.3 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  47 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  48.11 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  49.02 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  49.02 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  49.02 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  49.02 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  50 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  48.6 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  45.19 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  53.57 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  56.04 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  48.84 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  46.73 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  45.37 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  52.38 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  45.54 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  43.69 
 
 		 109 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  44.66 
 
 		 259 aa  107  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  41.9 
 
 		 114 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  45.79 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  46.73 
 
 		 108 aa  105  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  48.35 
 
 		 238 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  43.56 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  49.47 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  52.38 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  49.45 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  53.57 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  48 
 
 		 109 aa  104  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  47.67 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  48.39 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  49.02 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  43.24 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  48.42 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  47.12 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  52.17 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  44.44 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  51.61 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  43.93 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  49.47 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  44.44 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  52.38 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  51.61 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  102  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  46.08 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  51.06 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  46.51 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  46.73 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  42.06 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  44.86 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  44.86 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  51.06 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  52.13 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  45.63 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  46 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  45.37 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  46 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  46 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  44.86 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  51.65 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  44.44 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  48.04 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  46.53 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>