46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3146 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  842    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  44.1 
 
 		 410 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  42.55 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  42 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  47.09 
 
 		 367 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  41.95 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  42.47 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  43.9 
 
 		 411 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  41.49 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  41.51 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40.37 
 
 		 391 aa  279  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  40.91 
 
 		 394 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  39.78 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  41.97 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  40.21 
 
 		 408 aa  263  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  40.05 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  36.51 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  39.51 
 
 		 408 aa  256  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  38.38 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  37.73 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  37.37 
 
 		 427 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  38.86 
 
 		 397 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  38.48 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  37.47 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  38.33 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  35.04 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  39.63 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  42.36 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  38.07 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  34.05 
 
 		 405 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  36.49 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  37.04 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  37.08 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  39.12 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  40 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  23.56 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  22.89 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  27.5 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3757  ABC transporter substrate-binding protein  28.85 
 
 		 409 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  26.62 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.54 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>