38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0053 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1091    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.594463 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1373  AAA ATPase  39.92 
 
 		 572 aa  350  4e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.280618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1577 aa  90.9  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.12 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0466  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1692 aa  65.1  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189828  normal  0.0732856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.19 
 
 		 608 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1743 aa  64.3  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  25.88 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  24.65 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.3 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  23.29 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.79 
 
 		 595 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.93 
 
 		 523 aa  57  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  24.54 
 
 		 496 aa  56.6  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  24.5 
 
 		 686 aa  55.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.1 
 
 		 523 aa  54.3  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  21.54 
 
 		 496 aa  54.3  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  25.29 
 
 		 1090 aa  53.9  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  24.78 
 
 		 524 aa  53.9  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  23.63 
 
 		 524 aa  53.5  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  21.74 
 
 		 559 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.23 
 
 		 629 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.31 
 
 		 630 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  22.49 
 
 		 989 aa  50.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  25.87 
 
 		 989 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0397  hypothetical protein  21.98 
 
 		 325 aa  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.44 
 
 		 657 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  23.29 
 
 		 777 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  20.95 
 
 		 564 aa  47.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  23.15 
 
 		 540 aa  47.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.1 
 
 		 631 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  23.61 
 
 		 911 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1698 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  22.46 
 
 		 546 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  31.68 
 
 		 575 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  25.85 
 
 		 1034 aa  44.3  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  22.51 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  26.27 
 
 		 563 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>