More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2443 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  100 
 
 
304 aa  603  1e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  9.10512e-07  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  80.07 
 
 
303 aa  462  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1393  periplasmic binding protein  50.65 
 
 
317 aa  284  2e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310826  normal  0.0475326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  48.71 
 
 
357 aa  243  4e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  44.37 
 
 
294 aa  236  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  47.14 
 
 
362 aa  234  2e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3565  periplasmic binding protein  47.48 
 
 
360 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2167  periplasmic binding protein  40.74 
 
 
276 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579619  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0075  periplasmic binding protein  42.96 
 
 
335 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3080  periplasmic binding protein  40.91 
 
 
302 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3535  periplasmic binding protein  41.04 
 
 
276 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.862472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1739  periplasmic binding protein  39.68 
 
 
273 aa  174  1e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.102964  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7224  periplasmic binding protein  34.15 
 
 
276 aa  173  3e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2834  periplasmic binding protein  42.08 
 
 
271 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0648  hemin-binding periplasmic protein  37.34 
 
 
279 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3891  periplasmic binding protein  37.34 
 
 
279 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3803  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  37.34 
 
 
279 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.656087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1210  periplasmic binding protein  42.08 
 
 
270 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2460  periplasmic binding protein  35.25 
 
 
272 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2386  binding-protein-dependent transport lipoprotein  38.43 
 
 
355 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2762  periplasmic binding protein  35.25 
 
 
272 aa  164  2e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.599111  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2339  periplasmic binding protein  36.82 
 
 
316 aa  163  4e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4861  periplasmic-binding protein  37.69 
 
 
284 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0573  hemin-binding periplasmic protein hmuT  36.26 
 
 
278 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472949  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3804  periplasmic-binding protein  37.69 
 
 
304 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.118967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3879  periplasmic binding protein  38.08 
 
 
379 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4203  periplasmic binding protein  38.02 
 
 
291 aa  154  3e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.564967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2873  periplasmic binding protein  37.78 
 
 
364 aa  153  3e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0826  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  38.89 
 
 
308 aa  152  6e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1778  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  38.89 
 
 
308 aa  152  6e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1828  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  38.89 
 
 
308 aa  152  6e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2092  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  38.89 
 
 
308 aa  152  6e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1118  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  38.89 
 
 
308 aa  152  6e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.403801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0345  periplasmic binding protein  36.15 
 
 
282 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2734  ABC transporter substrate binding protein (hemin)  34.75 
 
 
312 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0438  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  38.89 
 
 
308 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2759  periplasmic binding protein  35.46 
 
 
380 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.199201  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0124  periplasmic binding protein  34.47 
 
 
295 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  1.58909e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2141  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  36.51 
 
 
308 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0345  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  38.89 
 
 
308 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4774  periplasmic binding protein  35.27 
 
 
302 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5317  periplasmic binding protein  35.27 
 
 
290 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0182  periplasmic binding protein  37.6 
 
 
296 aa  149  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0861033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3336  periplasmic binding protein  37.75 
 
 
304 aa  148  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383489  hitchhiker  0.00144742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2752  periplasmic binding protein  37.89 
 
 
275 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0371  periplasmic binding protein  37.35 
 
 
380 aa  146  4e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5376  hemin-binding periplasmic protein HmuT  34.02 
 
 
283 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00368111  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0219  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  37.35 
 
 
305 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2134  periplasmic binding protein  35.38 
 
 
296 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342061  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3620  periplasmic binding protein  36.08 
 
 
297 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4836  periplasmic binding protein  37.35 
 
 
305 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5433  periplasmic binding protein  37.35 
 
 
305 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0579041  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5429  periplasmic binding protein  37.35 
 
 
305 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1566  periplasmic binding protein  34.89 
 
 
289 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2124  periplasmic binding protein  35.19 
 
 
346 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1442  periplasmic binding protein  32.98 
 
 
321 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0166  periplasmic binding protein  32.14 
 
 
323 aa  137  3e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2411  periplasmic binding protein  32.75 
 
 
323 aa  137  3e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09830  ABC-type hemin transport system, periplasmic component  35.42 
 
 
394 aa  134  2e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423992  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2350  periplasmic binding protein  31.65 
 
 
323 aa  132  7e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048634  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4588  periplasmic binding protein  39.68 
 
 
292 aa  131  1e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1931  periplasmic binding protein  35.94 
 
 
302 aa  131  2e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001352  periplasmic hemin-binding protein  34.55 
 
 
289 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00152627  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0457  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  29.41 
 
 
303 aa  129  4e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.251804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4192  periplasmic binding protein  34.55 
 
 
320 aa  128  9e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0568253  normal  0.138797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0853  periplasmic binding protein  32.93 
 
 
280 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1969  periplasmic binding protein  30.29 
 
 
329 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3270  periplasmic binding protein  31.37 
 
 
309 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0101899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4687  periplasmic binding protein  33.86 
 
 
294 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0140247  hitchhiker  7.56756e-10 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05241  ABC-type hemin transport system periplasmic component  33.74 
 
 
289 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0324  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein HutB  33.07 
 
 
277 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1605  periplasmic binding protein  30.15 
 
 
279 aa  121  2e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.78278e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0745  periplasmic binding protein  31.84 
 
 
294 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.124358  hitchhiker  1.1582e-10 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4553  periplasmic binding protein  33.59 
 
 
294 aa  118  1e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697431  hitchhiker  1.25812e-07 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0993  periplasmic binding protein  33.46 
 
 
299 aa  117  2e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00265339  hitchhiker  7.89145e-11 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1754  heme transporter protein HuvB, putative periplasmic binding protein  29.92 
 
 
290 aa  117  2e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4689  periplasmic binding protein  33.2 
 
 
294 aa  116  4e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3019  periplasmic binding protein  31.82 
 
 
309 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.184479  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01536  ABC-type hemin transport system, periplasmic component  29.92 
 
 
318 aa  115  1e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62300  hypothetical protein  30.66 
 
 
297 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0763709  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1488  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
310 aa  110  4e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  26.96 
 
 
318 aa  108  7e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  27.55 
 
 
318 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3673  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  29.02 
 
 
317 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3331  periplasmic binding protein  28.43 
 
 
312 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5424  hypothetical protein  31.2 
 
 
297 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0962  periplasmic binding protein  29.46 
 
 
348 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3342  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
343 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0029736  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1050  periplasmic binding protein  27.96 
 
 
343 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4800  periplasmic binding protein  29.34 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000643232  hitchhiker  0.00663707 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3239  periplasmic binding protein  28.74 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0948  periplasmic binding protein  28.29 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.971026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  31.84 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1017  periplasmic binding protein  28.29 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.951283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4008  periplasmic binding protein  26.05 
 
 
304 aa  96.3  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2324  periplasmic binding protein  30.28 
 
 
288 aa  94  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0524222  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  32.41 
 
 
483 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  29.55 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  27.34 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  27.04 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>