225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2074 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  69.6 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51.84 
 
 		 258 aa  264  8e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 255 aa  258  8e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  46.56 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.58 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  51.01 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  48.37 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  48.99 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  47.97 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  47.56 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  47.56 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 		 256 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  47.56 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  47.56 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  47.97 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  48.37 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 256 aa  241  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  47.41 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  46.96 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  48.99 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  48.57 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  47.41 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  48.4 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  48.99 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 		 252 aa  232  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  47.15 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  46 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  47.22 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 244 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  48.57 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  46 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 249 aa  228  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  48.57 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  47.77 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  47.41 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  47.97 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 244 aa  221  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 244 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  46.56 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  46.94 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  46.67 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  46.67 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  45.78 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  46.25 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 245 aa  214  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  42.32 
 
 		 242 aa  214  9e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.78 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  43.58 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  45.34 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>