More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0262 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  100 
 
 		 276 aa  555  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  46.03 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  41.27 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  39.53 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  42.63 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35.21 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  34.18 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  33.65 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  33.89 
 
 		 323 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  36.03 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  36.51 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  34.59 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  32.63 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  34.62 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  35.79 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  36.16 
 
 		 346 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  33.67 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  36.16 
 
 		 346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  36.43 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.33 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  35.32 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  34.01 
 
 		 347 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  34.32 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  33.33 
 
 		 345 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  33.44 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.59 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.59 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  34.33 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  32.99 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  30.77 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.59 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.59 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.59 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  32.99 
 
 		 348 aa  146  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.59 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  31.41 
 
 		 317 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.96 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.22 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  35.71 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  33.8 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.22 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  37.11 
 
 		 298 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  32.13 
 
 		 335 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  33.44 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  34.19 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  35.44 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  32.55 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  33.1 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.19 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  37.5 
 
 		 327 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  30.55 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  31.77 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.58 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  34.78 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  34.07 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  32.42 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  34.42 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  34.42 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  33.94 
 
 		 349 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  30.95 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3127  patatin  35.91 
 
 		 344 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  32.55 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  30.3 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  36.33 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  34.06 
 
 		 306 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  34.06 
 
 		 305 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  34.06 
 
 		 305 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.82 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  35.07 
 
 		 293 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.46 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2340  alpha-beta hydrolase family esterase  31.19 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  33.7 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  32.58 
 
 		 323 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  31.67 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  32.04 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  32.35 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  33.7 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  33.7 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  33.7 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.73 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  33.7 
 
 		 474 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  34.94 
 
 		 324 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  34.19 
 
 		 358 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  31.88 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  29.63 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  33.58 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  30.39 
 
 		 728 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.32 
 
 		 760 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.27 
 
 		 728 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  31.27 
 
 		 751 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  33.33 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  30.85 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  30.85 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  33.46 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  30.99 
 
 		 727 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.16 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  32.08 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  29.83 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  32.23 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>