More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0033 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0033  histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  875    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3007  histidine kinase  45.6 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  36.46 
 
 		 542 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 469 aa  136  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  34.85 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2214  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  34.07 
 
 		 507 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3742  sensor protein BasS/PmrB  35.03 
 
 		 355 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3608  sensor protein BasS/PmrB  35.03 
 
 		 355 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000312076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  37.46 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.8 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.8 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.8 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  34.27 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.55 
 
 		 477 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 524 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2736  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  33.33 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  33.58 
 
 		 555 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  32.19 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 524 aa  127  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 478 aa  126  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 543 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  36.79 
 
 		 508 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0643  histidine kinase  30.18 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 500 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 537 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.89 
 
 		 486 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 495 aa  123  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 482 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  32.9 
 
 		 475 aa  123  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 459 aa  123  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.57 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.54 
 
 		 518 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 515 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.5 
 
 		 455 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 475 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  35.09 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  31.65 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.22 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  31.92 
 
 		 524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 436 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  32.42 
 
 		 593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  31.99 
 
 		 411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  32.09 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  29.28 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  32.67 
 
 		 469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  28.42 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0275  histidine kinase  28.08 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.937393  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.43 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 515 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  24.12 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  24.12 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  30.43 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  30.1 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2684  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 513 aa  117  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  28.43 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  25.49 
 
 		 448 aa  117  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  32.09 
 
 		 583 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 607 aa  116  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  30.47 
 
 		 479 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 488 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  33.45 
 
 		 469 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 523 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 455 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 477 aa  116  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 531 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>