More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6405 on replicon NC_010517
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010514  Mrad2831_6375  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 108 aa  216  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6405  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 108 aa  216  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  51 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  56.12 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  51.96 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  52.83 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  54.08 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  55 
 
 		 101 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  56.25 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  55.1 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 104 aa  100  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  54.08 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  51.61 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  51.49 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  51.02 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  49.02 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  49.02 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  49.02 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  53.41 
 
 		 98 aa  94.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5215  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243034  normal  0.450992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 94 aa  91.3  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 94 aa  91.3  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 94 aa  91.3  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 93 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  43.24 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  49.47 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  48.39 
 
 		 112 aa  87.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  51.61 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  46.24 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  47.73 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1307  histone family protein DNA-binding protein  49.47 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.226884  hitchhiker  0.000000648768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  46.59 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  48.39 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1007  histone family protein DNA-binding protein  46.39 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  46.24 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  47.83 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  44.32 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  46.59 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  45.16 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  43.48 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  45.45 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  45.45 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  45.36 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  39.78 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  46.59 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  44.9 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  42.16 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  38.04 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  44.09 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0928  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0924  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  42.39 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3362  histone family protein DNA-binding protein  44.68 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.936613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  40.91 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000109165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  46.07 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  44.32 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  44.32 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  42.05 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  42.05 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  41.18 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0965  integration host factor, beta subunit  47.73 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  43.82 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  44.32 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  42.73 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  40.22 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  39.77 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>