180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2074 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2074  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.83722  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2120  cyclic nucleotide-binding  87.19 
 
 
243 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0341739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2397  cyclic nucleotide-binding protein  86.78 
 
 
243 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  65.97 
 
 
242 aa  318  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.21 
 
 
239 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3376  cyclic nucleotide-binding protein  48.02 
 
 
236 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.23 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5594  hypothetical protein  45.45 
 
 
238 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0789  cyclic nucleotide-binding  46.93 
 
 
240 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.424436  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0788  cyclic nucleotide-binding  46.29 
 
 
236 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0061  cyclic nucleotide-binding protein  45.85 
 
 
237 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3386  cyclic nucleotide-binding protein  45.85 
 
 
237 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0075  hypothetical protein  45.41 
 
 
237 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0784  hypothetical protein  44.98 
 
 
237 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5606  cyclic nucleotide-binding protein  43.86 
 
 
241 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6128  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.72 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1834  cyclic nucleotide-binding protein  44.68 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5843  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.61 
 
 
254 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918646  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.4 
 
 
244 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156733  normal  0.417355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4966  cyclic nucleotide-binding protein  42.44 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.916319  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4306  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3860  cyclic nucleotide-binding protein  46.46 
 
 
237 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5764  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.48 
 
 
237 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.88 
 
 
241 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6918  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.17 
 
 
255 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5879  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.87 
 
 
255 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5837  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.43 
 
 
255 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561164  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7015  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.03 
 
 
241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0954558  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4307  cyclic nucleotide-binding protein  37 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5598  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.3 
 
 
239 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118165 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6894  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.06 
 
 
241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.744269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1833  Crp/FNR family transcriptional regulator  47 
 
 
237 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.52 
 
 
245 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0741  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.77 
 
 
241 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.74 
 
 
239 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192457  normal  0.0307688 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.5 
 
 
384 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.5 
 
 
219 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  35.4 
 
 
230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
260 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  35.68 
 
 
259 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
238 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  33.62 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.48 
 
 
246 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  33.48 
 
 
246 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
260 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  33.19 
 
 
236 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
263 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
238 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3818  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.64 
 
 
265 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
232 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.59 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3898  regulatory protein Crp  33.33 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4266  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  32.89 
 
 
258 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
239 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
239 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.89 
 
 
247 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  32.74 
 
 
234 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  34.32 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
247 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
268 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
239 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
239 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
244 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4369  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.48 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.324927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.74 
 
 
239 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 
254 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  35.22 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.96 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.21 
 
 
239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  36.16 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  33.9 
 
 
269 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  33.9 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  33.9 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  33.9 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  33.9 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  33.9 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  33.9 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  34.06 
 
 
242 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.31 
 
 
244 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
244 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>