163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0551 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  718    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  69.7 
 
 
404 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  63.09 
 
 
360 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  59.84 
 
 
394 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  61.71 
 
 
368 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  56.49 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  61.39 
 
 
366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  61.1 
 
 
376 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  62.36 
 
 
362 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  59.06 
 
 
337 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  57.02 
 
 
369 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  56.03 
 
 
396 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  55.23 
 
 
396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  53.99 
 
 
396 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  54.28 
 
 
396 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  54.16 
 
 
410 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  53.21 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  53.35 
 
 
410 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  53.35 
 
 
410 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  54.01 
 
 
396 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  53.35 
 
 
396 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  53.35 
 
 
396 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  53.35 
 
 
396 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  53.35 
 
 
396 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  53.35 
 
 
396 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  53.19 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  53.19 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  53.21 
 
 
397 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  53.35 
 
 
396 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  51.98 
 
 
397 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  49.47 
 
 
400 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  50.79 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  51.19 
 
 
397 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  50.68 
 
 
397 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  45.91 
 
 
386 aa  285  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  47.89 
 
 
391 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  44.09 
 
 
393 aa  279  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  46.11 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  45.81 
 
 
386 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  43.31 
 
 
424 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  45.88 
 
 
384 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  39.47 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  38.06 
 
 
395 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  39.15 
 
 
370 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  38.31 
 
 
370 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  36.16 
 
 
395 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  38.77 
 
 
417 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  38.5 
 
 
388 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  41.1 
 
 
403 aa  202  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  40.88 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  38.06 
 
 
394 aa  196  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  36.24 
 
 
394 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  35.98 
 
 
394 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  39.22 
 
 
394 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  40.23 
 
 
375 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  40.23 
 
 
451 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  31.86 
 
 
386 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  32.87 
 
 
378 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  35.6 
 
 
394 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  28.89 
 
 
384 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  32.02 
 
 
386 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  32.26 
 
 
387 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  30.81 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  35.48 
 
 
384 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  32.6 
 
 
398 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.22 
 
 
385 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  31.62 
 
 
393 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  32.8 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  30.34 
 
 
397 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  29.53 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  31.23 
 
 
377 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  31.58 
 
 
377 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  27.93 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  30.47 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  32.32 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  30.79 
 
 
386 aa  126  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  30.5 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  30.06 
 
 
394 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  34.85 
 
 
368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  30.38 
 
 
375 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  31.75 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2151  protein of unknown function DUF185  30.65 
 
 
340 aa  114  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510759  normal  0.0912925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  33.52 
 
 
363 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  31.37 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  33.52 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  33.06 
 
 
356 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  30.67 
 
 
375 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  25.63 
 
 
370 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  32.07 
 
 
376 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  32.89 
 
 
324 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  34.72 
 
 
362 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  28.61 
 
 
400 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  31.17 
 
 
379 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  31.5 
 
 
357 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  24.47 
 
 
370 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  30.28 
 
 
376 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  25.63 
 
 
335 aa  102  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  26.19 
 
 
401 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  23.96 
 
 
368 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  23.68 
 
 
370 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>