More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0406 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  100 
 
 
383 aa  785    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  63.45 
 
 
384 aa  502  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  54.91 
 
 
402 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  53.68 
 
 
391 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  45.43 
 
 
398 aa  292  6e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  35.05 
 
 
395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  40.92 
 
 
304 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  43.38 
 
 
304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.91 
 
 
523 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0870  subunit F of alkyl hydroperoxide reductase  38.32 
 
 
531 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.037495  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  42.27 
 
 
601 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  41.86 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0782  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.65 
 
 
531 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0983751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.75 
 
 
529 aa  213  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1196  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.69 
 
 
518 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000420739  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37 
 
 
314 aa  212  9e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  37.79 
 
 
323 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  42.26 
 
 
343 aa  211  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.86 
 
 
533 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.67 
 
 
326 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0649931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0666  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  41.01 
 
 
535 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.86 
 
 
533 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.86 
 
 
533 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0756  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  41.01 
 
 
535 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2044  alkyl hydroperoxide reductase subunit  41.01 
 
 
622 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  39.67 
 
 
312 aa  209  6e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.86 
 
 
532 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.53 
 
 
532 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.53 
 
 
532 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.4 
 
 
519 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1814  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.93 
 
 
523 aa  206  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.82 
 
 
525 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  36.57 
 
 
323 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3533  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.93 
 
 
520 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463079  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.93 
 
 
509 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0688  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.36 
 
 
530 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242332  normal  0.621191 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0047  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.11 
 
 
512 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5071  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  41.37 
 
 
518 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.132309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3107  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  40.98 
 
 
520 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00119955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.78 
 
 
518 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0640975  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
308 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00575  alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)-binding  40.31 
 
 
521 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00564  hypothetical protein  40.31 
 
 
521 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3018  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.31 
 
 
531 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.531369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0259  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.84 
 
 
527 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00384538 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  40.31 
 
 
531 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0520  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  40.31 
 
 
531 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3037  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.31 
 
 
531 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0692  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  40.31 
 
 
531 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.766507  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  40.31 
 
 
531 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0658  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  40.31 
 
 
531 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.75 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0449918  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.33 
 
 
520 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250232  normal  0.0117128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3656  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.53 
 
 
530 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  32.66 
 
 
560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1206  AhpF  39.53 
 
 
530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001914  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1091  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.21 
 
 
535 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.08 
 
 
523 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2440  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.29 
 
 
520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2924  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  37.8 
 
 
520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  37.79 
 
 
306 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0439  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36.77 
 
 
507 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00965821  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0428  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36.77 
 
 
507 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.273089  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0845  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.87 
 
 
312 aa  199  6e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5402  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.53 
 
 
530 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000100097  normal  0.196114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.18 
 
 
529 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.054716 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  35.81 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  35.81 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.49 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3453  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.94 
 
 
522 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455545  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3255  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36.04 
 
 
520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2094  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.82 
 
 
523 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37 
 
 
521 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3186  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.18 
 
 
520 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1146  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.81 
 
 
521 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.337025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26320  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.39 
 
 
521 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1417  thioredoxin-disulfide reductase  34.85 
 
 
526 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.18 
 
 
521 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0059  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.83 
 
 
507 aa  196  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.492285  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  34.8 
 
 
334 aa  196  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  38.94 
 
 
521 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.401893  hitchhiker  0.00190824 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  37.58 
 
 
340 aa  195  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  37.54 
 
 
306 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1535  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.12 
 
 
526 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000673423  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2074  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.26 
 
 
525 aa  195  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.113135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4716  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  37.3 
 
 
523 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1376  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.23 
 
 
522 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.03 
 
 
525 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  37.03 
 
 
340 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0619  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  32.66 
 
 
515 aa  193  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.633675 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  34.19 
 
 
510 aa  193  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1795  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  34.68 
 
 
525 aa  193  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114206  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  37.75 
 
 
306 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01720  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.44 
 
 
521 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  37.58 
 
 
520 aa  193  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  38.13 
 
 
306 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0246  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  39.34 
 
 
524 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0118696  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  38.66 
 
 
519 aa  192  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0943  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.4 
 
 
509 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.34 
 
 
532 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>