More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5548 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
220 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5165  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  90.65 
 
 
218 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820799  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  69.95 
 
 
219 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  68.95 
 
 
219 aa  279  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  68.49 
 
 
219 aa  278  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  72.77 
 
 
216 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.18 
 
 
224 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.34 
 
 
222 aa  234  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1967  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.74 
 
 
236 aa  231  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.33 
 
 
216 aa  230  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.38 
 
 
209 aa  224  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.61 
 
 
222 aa  221  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.33 
 
 
218 aa  221  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.64 
 
 
214 aa  221  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.5 
 
 
220 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.57 
 
 
216 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.43 
 
 
212 aa  216  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.45 
 
 
216 aa  215  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57 
 
 
220 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57 
 
 
220 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.87 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.85 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.5 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.5 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.84 
 
 
211 aa  211  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.57 
 
 
220 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56 
 
 
220 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56 
 
 
220 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.22 
 
 
209 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.92 
 
 
216 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.92 
 
 
216 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.73 
 
 
212 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.94 
 
 
214 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.96 
 
 
221 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.76 
 
 
220 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.45 
 
 
221 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.93 
 
 
245 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1598  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.99 
 
 
217 aa  201  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.718303  normal  0.398382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3462  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.61 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.04 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.61 
 
 
192 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.37 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.55 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.79 
 
 
213 aa  194  7e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.49 
 
 
220 aa  194  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2488  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.81 
 
 
218 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.062829  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.49 
 
 
209 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.65 
 
 
210 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.03 
 
 
193 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.57 
 
 
210 aa  191  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3391  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.7 
 
 
194 aa  191  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
229 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.79 
 
 
206 aa  190  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2110  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0973  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1031  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.723337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0969  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.19 
 
 
192 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2729  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.25 
 
 
194 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.6 
 
 
220 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.682807  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.79 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.38 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
206 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.09 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.55 
 
 
315 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.97 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2956  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.06 
 
 
215 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.502503  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.08 
 
 
219 aa  187  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.59 
 
 
203 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.91 
 
 
226 aa  187  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.57 
 
 
215 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.79 
 
 
220 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1896  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.5 
 
 
219 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.7 
 
 
198 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.5 
 
 
219 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.56 
 
 
216 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1570  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.5 
 
 
219 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.13 
 
 
223 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.73 
 
 
222 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.06 
 
 
217 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1837  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.56 
 
 
197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.117962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.26 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.52 
 
 
212 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.52 
 
 
212 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.52 
 
 
212 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.57 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1275  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.95 
 
 
198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.34 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.67 
 
 
213 aa  181  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.5 
 
 
214 aa  181  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3927  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.08 
 
 
198 aa  181  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.78 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
205 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
205 aa  180  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.12 
 
 
216 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3437  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.61 
 
 
192 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.18 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.08 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.147128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.04 
 
 
199 aa  178  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>