177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2646 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  60.6 
 
 		 301 aa  332  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  57.95 
 
 		 530 aa  299  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  54.21 
 
 		 275 aa  292  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  54.92 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  52.08 
 
 		 288 aa  278  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  51.36 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  47.95 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  45.96 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  42.81 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.71 
 
 		 307 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  46.34 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  42.86 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2173  DNA adenine methyltransferase  40.43 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.134955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.63 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.95 
 
 		 673 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.62 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.1 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.6 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.52 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  34.12 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.22 
 
 		 284 aa  116  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.78 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.78 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.06 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 253 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.47 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  29.91 
 
 		 253 aa  89  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.12 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.87 
 
 		 268 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  29.49 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.5 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  34.71 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  29.06 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  33.88 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  34.71 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  31.23 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  29.74 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.45 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  29.11 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  29.11 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.31 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.33 
 
 		 704 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.08 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.38 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  26.67 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.47 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  29.15 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  28.39 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  25.75 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.04 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.94 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.94 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  29.15 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.27 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  26.72 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  24.64 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  24.26 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  24.26 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  26.42 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  27.35 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  29.48 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  26.72 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  30.66 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.75 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.47 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  24.15 
 
 		 264 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  26.05 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  27.57 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  27.44 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  28.52 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  25.46 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  25.96 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  24.89 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  26.21 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  25 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  33.77 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  25.82 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  26.44 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  25.27 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  25.27 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  25.93 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  25.27 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  25.27 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  24.54 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  25.27 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  25.27 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  25.27 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  25.27 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  27.71 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  25.84 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  26.05 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  24.32 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.73 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  25.89 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  24.91 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  24.77 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  28.57 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  23.66 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  24.41 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>