132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0358 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2250  hypothetical protein  71.31 
 
 		 269 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0744854  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3184  hypothetical protein  58.3 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  41.84 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  39.18 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  32.13 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  30.54 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  37.39 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  29.29 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  34.98 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  34.38 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  25.1 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  33.73 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  32.31 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.79 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  34.98 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  29.91 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  31.2 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  31.02 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  38.25 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  34.52 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  34.09 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  31.3 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  35.09 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  29.53 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  34.22 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  31.36 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  37.5 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  34.78 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3993  hypothetical protein  29.58 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0129209  normal  0.0990612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  32.84 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  30.38 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  28.09 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  30.27 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  29.92 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  36.31 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  32.48 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  33.78 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  29.73 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  28.16 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  30.56 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.58 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  30.25 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  30.22 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.39 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0920  hypothetical protein  34.25 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.81019e-33 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  34.44 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3977  hypothetical protein  31.21 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  33.5 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  30.74 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  29.63 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  31.95 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  35.74 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  35.74 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  35.74 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  30.22 
 
 		 289 aa  72  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  38.33 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  31.03 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.31 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3326  hypothetical protein  32.04 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.884762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  29.31 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  30.6 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  32.51 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  32.2 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  26.91 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  26.86 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3153  hypothetical protein  31.75 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  30.88 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  29.69 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  28.9 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4186  putative alpha/beta superfamily hydrolase  32 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0367374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0852  hypothetical protein  29.29 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  29.73 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  28.65 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  29.82 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1334  hydrolase with alpha/beta fold  25.23 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.706412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  26.91 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  27.14 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  30.28 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  26.58 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  29 
 
 		 292 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  29 
 
 		 292 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  29 
 
 		 292 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  29.82 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.82 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  25.68 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  25.68 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  25.68 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  24.87 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  25.68 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  25.68 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1061  temperature sensitive supressor-like protein  26.96 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.133168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  29.82 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  25.68 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  25.68 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>