62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3038 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
288 aa  587  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  65.28 
 
 
288 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  67.73 
 
 
304 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  57.04 
 
 
289 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  48.33 
 
 
293 aa  257  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  42.76 
 
 
293 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  41.75 
 
 
295 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  43.89 
 
 
293 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  41.4 
 
 
295 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  41.4 
 
 
295 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  40.93 
 
 
291 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  43.89 
 
 
293 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  41.13 
 
 
293 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 
303 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
291 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  39.93 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  38.72 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  43.82 
 
 
292 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 
317 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
299 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  39.42 
 
 
295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  39.42 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  41.61 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  40.66 
 
 
299 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 
298 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  39.85 
 
 
307 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  39.85 
 
 
307 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  41.29 
 
 
291 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  39.85 
 
 
307 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  39.03 
 
 
291 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  41.01 
 
 
283 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
486 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  37.78 
 
 
444 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
395 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 
307 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
404 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
404 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
404 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
404 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
395 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  39.1 
 
 
307 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.45 
 
 
296 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  37.46 
 
 
292 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.46 
 
 
299 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  35.49 
 
 
293 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 
266 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  33.21 
 
 
292 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  30.6 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  30.69 
 
 
293 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  26.97 
 
 
302 aa  112  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  23.9 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  22.71 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 
526 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  22.13 
 
 
278 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  22.73 
 
 
298 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  27.61 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  27.82 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 
332 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>