77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0210 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  35.5 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  29.38 
 
 		 310 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  33.56 
 
 		 345 aa  85.5  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  30.87 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  32.21 
 
 		 346 aa  81.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  30.48 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  28.32 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  28.12 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  29.06 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  28.08 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  27.84 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  27.66 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  30.38 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  25.91 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  26.4 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  27.37 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  26.34 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  26.46 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  24.87 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  25 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  24.49 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  25.16 
 
 		 520 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  25.52 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  24.87 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  24.87 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  24.87 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  23.72 
 
 		 520 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  27.16 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  27.74 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  28.47 
 
 		 508 aa  51.2  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  29.41 
 
 		 521 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  31.82 
 
 		 533 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  34.07 
 
 		 525 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  27.61 
 
 		 530 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  28.57 
 
 		 533 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  34.94 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  24.59 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  24.83 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  36.67 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  25.55 
 
 		 516 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  30.43 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  29.55 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  27.07 
 
 		 498 aa  45.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  31.68 
 
 		 536 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  26.92 
 
 		 518 aa  44.7  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  27.01 
 
 		 517 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2252  putative serine protease  52.38 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  25.55 
 
 		 498 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  26.47 
 
 		 523 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3183  shikimate kinase  37.68 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.020728  hitchhiker  0.00306949 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  28.75 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  22.89 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  25.68 
 
 		 532 aa  42.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  33.67 
 
 		 499 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  45.24 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  58.33 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  38.98 
 
 		 173 aa  42  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  24.46 
 
 		 513 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  25.32 
 
 		 520 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  54.55 
 
 		 264 aa  42  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1850  shikimate kinase  42.86 
 
 		 174 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  39.13 
 
 		 166 aa  42  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  39.53 
 
 		 190 aa  42  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  30.19 
 
 		 202 aa  42  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  24.11 
 
 		 579 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  30.77 
 
 		 522 aa  41.6  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  38.71 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  51.43 
 
 		 235 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  45.71 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  51.43 
 
 		 235 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  51.43 
 
 		 235 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  22.14 
 
 		 529 aa  41.2  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  26.28 
 
 		 513 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  36.67 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  28.57 
 
 		 540 aa  41.2  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  51.35 
 
 		 165 aa  41.2  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>