More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0689 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0689  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0763573  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  53.63 
 
 		 193 aa  201  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  53.63 
 
 		 193 aa  200  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  53.63 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.72 
 
 		 194 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  53.63 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  50.85 
 
 		 193 aa  197  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  53.76 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  54.91 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  59.24 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  53.76 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  53.76 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  53.76 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  51.08 
 
 		 198 aa  194  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  53.76 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  53.76 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.74 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.84 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  54.34 
 
 		 189 aa  190  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  56.02 
 
 		 191 aa  189  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  52.3 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  54.91 
 
 		 205 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  57.14 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  57.76 
 
 		 189 aa  187  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  52.35 
 
 		 188 aa  187  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  55.09 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  52.87 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  52.3 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  51.41 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  51.41 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  48.89 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  51.41 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  53.41 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  50.28 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.41 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  54.39 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  54.39 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  54.6 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  54.39 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1571  electron transport complex protein RnfB  54.6 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  54.39 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  54.6 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  54.39 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1820  electron transport complex protein RnfB  54.27 
 
 		 192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  51.18 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.12 
 
 		 196 aa  181  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  53.8 
 
 		 192 aa  180  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  51.23 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  54.19 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  54.04 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19260  electron transport complex protein RnfB  51.41 
 
 		 187 aa  178  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1568  electron transport complex protein RnfB  52.63 
 
 		 192 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0321479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1628  electron transport complex protein RnfB  52.63 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0262939  normal  0.320495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1884  electron transport complex protein RnfB  52.63 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  51.72 
 
 		 190 aa  177  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1716  electron transport complex protein RnfB  52.05 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.270473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1556  electron transport complex protein RnfB  52.05 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0733084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.29 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1060  electron transport complex protein RnfB  53.9 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  52.17 
 
 		 197 aa  175  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  51.57 
 
 		 191 aa  174  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2324  electron transport complex protein RnfB  52.2 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2024  electron transport complex protein RnfB  52.2 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.13 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0720  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  56.33 
 
 		 681 aa  168  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2823  electron transport complex, B subunit  45.45 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1035  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.86 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  58.14 
 
 		 335 aa  157  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.77 
 
 		 186 aa  154  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1493  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.06 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  53.85 
 
 		 404 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  45.36 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0473015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3193  electron transport complex protein rnfB  44.25 
 
 		 188 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.676371  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3932  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.68 
 
 		 188 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  53.08 
 
 		 291 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.25 
 
 		 259 aa  144  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4148  iron-sulfur cluster-binding protein  52.31 
 
 		 291 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0850  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.35 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.223684  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0994  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.35 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0262542  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50970  Electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.27 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0817561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  51.05 
 
 		 279 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  52.67 
 
 		 137 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0284  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.28 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.419432  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  51.54 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  51.54 
 
 		 139 aa  130  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  50.72 
 
 		 248 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2349  ferredoxin  43.79 
 
 		 306 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  51.45 
 
 		 279 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1714  ferredoxin  43.79 
 
 		 342 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2326  ferredoxin  43.79 
 
 		 342 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  40.11 
 
 		 341 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2975  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  49.65 
 
 		 224 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5668  ferredoxin  42.41 
 
 		 334 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  40.11 
 
 		 339 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  48.91 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0951  ferredoxin  42.41 
 
 		 320 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  53.08 
 
 		 142 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3310  ferredoxin  46.41 
 
 		 279 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2487  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.55 
 
 		 243 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  0.0921723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>