52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_20770 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  100 
 
 
170 aa  338  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  58.06 
 
 
184 aa  176  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  51.24 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  46.97 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  45.63 
 
 
109 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  43.38 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  47.66 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  48.65 
 
 
136 aa  90.9  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  42.72 
 
 
153 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  36.13 
 
 
153 aa  87.4  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  40.98 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  42.86 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  39.47 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  40.57 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  41.58 
 
 
155 aa  84.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  36.79 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  36.79 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  40.59 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  40.59 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  48.86 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  36.89 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  41.49 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  35.05 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  36 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  37.86 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  34.95 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  46.25 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  44.44 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  37.23 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  34.38 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  40.91 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  34.45 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  28.57 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  32.46 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0804  regulatory protein MerR  35.64 
 
 
132 aa  57.8  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  31.86 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  33.98 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  36.96 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  36.96 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  51.52 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  45.45 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  35.29 
 
 
166 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  44.23 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 
64 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  44.44 
 
 
64 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  43.86 
 
 
64 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  38.57 
 
 
127 aa  41.2  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1601  DNA binding domain protein, excisionase family  36.14 
 
 
128 aa  41.2  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3695  DNA binding domain-containing protein  36.92 
 
 
210 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>