41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_06480 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  100 
 
 
500 aa  1009    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  39.58 
 
 
495 aa  316  7e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  41.74 
 
 
495 aa  312  7.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  41.09 
 
 
495 aa  296  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  33.74 
 
 
509 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  32.29 
 
 
711 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  32.29 
 
 
696 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  31.03 
 
 
505 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  32.25 
 
 
515 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  30.55 
 
 
480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  31.26 
 
 
502 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  29.63 
 
 
461 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  28.6 
 
 
511 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  28.41 
 
 
516 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  27.54 
 
 
496 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  28.18 
 
 
575 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  29.26 
 
 
512 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0205  AAA ATPase  29.16 
 
 
385 aa  109  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.519462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.56 
 
 
608 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.44 
 
 
629 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  25.42 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  25.56 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  24.74 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  25.55 
 
 
518 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  25.85 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.52 
 
 
595 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.35 
 
 
631 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  26.09 
 
 
624 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.46 
 
 
659 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  23.35 
 
 
610 aa  67  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.72 
 
 
611 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  22.55 
 
 
644 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  20.35 
 
 
645 aa  57.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  25.13 
 
 
569 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  20.35 
 
 
818 aa  50.8  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.04 
 
 
1043 aa  47.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  21.07 
 
 
621 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  24.49 
 
 
1085 aa  44.3  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  24.89 
 
 
779 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  30 
 
 
616 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  24.17 
 
 
955 aa  43.5  0.01  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>