131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0186 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  100 
 
 
228 aa  450  1e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  62.88 
 
 
253 aa  285  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  47.47 
 
 
221 aa  208  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  46.09 
 
 
231 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  42.51 
 
 
230 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  49.52 
 
 
224 aa  178  6e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  49.05 
 
 
224 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  40.36 
 
 
232 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  45.29 
 
 
235 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  47.64 
 
 
224 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  45.89 
 
 
230 aa  171  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  40.36 
 
 
227 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  48.57 
 
 
224 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  37.5 
 
 
208 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  42.08 
 
 
224 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  40 
 
 
227 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  41.2 
 
 
224 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  42.99 
 
 
228 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  38.4 
 
 
250 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  41.12 
 
 
226 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  42.47 
 
 
236 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  42.47 
 
 
226 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  42.47 
 
 
226 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  42.47 
 
 
226 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  37.61 
 
 
229 aa  140  1e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  41.1 
 
 
226 aa  140  1e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  41.55 
 
 
226 aa  139  2e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  38.6 
 
 
230 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  41.1 
 
 
226 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  43.72 
 
 
259 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  39.64 
 
 
233 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  41.05 
 
 
251 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  40.99 
 
 
230 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  41.55 
 
 
226 aa  136  3e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  41.28 
 
 
236 aa  135  6e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  41.28 
 
 
236 aa  135  6e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  41.28 
 
 
236 aa  135  7e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  41.28 
 
 
236 aa  135  7e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  41.28 
 
 
236 aa  135  7e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  41.28 
 
 
226 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  40.18 
 
 
226 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  41.28 
 
 
226 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  40 
 
 
224 aa  134  1e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  38.32 
 
 
225 aa  133  2e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  36.5 
 
 
288 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  37.61 
 
 
226 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  38.03 
 
 
223 aa  131  7e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  38.81 
 
 
226 aa  129  4e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  35.68 
 
 
232 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  39.34 
 
 
227 aa  124  8e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  36.29 
 
 
230 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  40.81 
 
 
229 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  41.28 
 
 
224 aa  120  2e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  39.64 
 
 
229 aa  119  5e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  41.36 
 
 
224 aa  119  5e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  37.17 
 
 
227 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  39.91 
 
 
224 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  39.19 
 
 
237 aa  117  1e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  37.95 
 
 
224 aa  117  2e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  38.33 
 
 
238 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  41.44 
 
 
223 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  42.48 
 
 
223 aa  114  8e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  37.67 
 
 
223 aa  114  1e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  39.47 
 
 
224 aa  113  2e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  37.89 
 
 
229 aa  112  4e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  37.22 
 
 
225 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  34.2 
 
 
237 aa  109  4e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  34.7 
 
 
288 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  31.86 
 
 
241 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1050  urease accessory protein ureF  31.36 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  30.92 
 
 
269 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19211  urease accessory protein UreF  31.36 
 
 
223 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  32.27 
 
 
240 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  34.78 
 
 
223 aa  98.2  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
309 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  27.15 
 
 
228 aa  91.7  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  30.77 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  31.2 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  28.83 
 
 
228 aa  89  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  32.58 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  30.97 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  26.46 
 
 
240 aa  86.7  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  22.07 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08881  urease accessory protein UreF  22.52 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.751902  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  20.72 
 
 
228 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  32.77 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  30.53 
 
 
238 aa  84.7  1e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
250 aa  83.6  2e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  25.23 
 
 
229 aa  82.8  4e-15  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  24.55 
 
 
237 aa  81.6  1e-14  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  32.73 
 
 
229 aa  80.5  2e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  30.32 
 
 
228 aa  80.5  2e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  28.19 
 
 
225 aa  76.3  4e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  33.94 
 
 
239 aa  75.9  4e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  31.82 
 
 
231 aa  74.3  1e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  30.7 
 
 
210 aa  72  7e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  28.02 
 
 
223 aa  71.6  8e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  30.7 
 
 
210 aa  71.6  9e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>