More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1251 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
405 aa  831    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  64.6 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  67.27 
 
 
388 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  61.19 
 
 
407 aa  524  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  58.54 
 
 
408 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 
412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  48.26 
 
 
404 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  47.39 
 
 
413 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  44.17 
 
 
413 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  45.61 
 
 
419 aa  363  3e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  48.42 
 
 
414 aa  362  8e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  48.3 
 
 
414 aa  358  7e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  47.93 
 
 
414 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  44.09 
 
 
409 aa  353  4e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  45.74 
 
 
414 aa  350  2e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  45.09 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  44.03 
 
 
408 aa  335  7.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  39.6 
 
 
408 aa  300  4e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  40.64 
 
 
409 aa  300  4e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  39.75 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  39.9 
 
 
408 aa  280  4e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  35.5 
 
 
412 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  39.55 
 
 
408 aa  268  1e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  37.88 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
415 aa  263  3e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  35.47 
 
 
407 aa  262  6.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.05 
 
 
650 aa  259  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  39.45 
 
 
393 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  38.97 
 
 
397 aa  249  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  41.36 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  38.57 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  36.19 
 
 
392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  36.86 
 
 
389 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  37.65 
 
 
395 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  38.29 
 
 
393 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  36.76 
 
 
646 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  36.57 
 
 
394 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  38.18 
 
 
396 aa  240  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  38.01 
 
 
398 aa  239  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  36.95 
 
 
393 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  36.98 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  38.85 
 
 
402 aa  234  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  37.59 
 
 
394 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  36.74 
 
 
394 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  37.16 
 
 
402 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  36.07 
 
 
396 aa  232  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  36.07 
 
 
396 aa  232  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  36.71 
 
 
399 aa  230  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  36.78 
 
 
395 aa  230  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  36.71 
 
 
399 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  34.05 
 
 
400 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  37.16 
 
 
401 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.05 
 
 
655 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  35.37 
 
 
394 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  37.1 
 
 
407 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  37.63 
 
 
397 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  34.72 
 
 
395 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  36.86 
 
 
397 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  35.59 
 
 
396 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  36.39 
 
 
403 aa  227  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  34.41 
 
 
396 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  36.5 
 
 
402 aa  227  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  35.06 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
396 aa  226  6e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  35.99 
 
 
400 aa  226  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
389 aa  226  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  36.61 
 
 
402 aa  225  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  36.47 
 
 
397 aa  225  9e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  35.11 
 
 
396 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  36.47 
 
 
397 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  36.25 
 
 
435 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  36.95 
 
 
393 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  36.8 
 
 
401 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  36.59 
 
 
400 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  36.59 
 
 
400 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  36.12 
 
 
395 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  38.05 
 
 
395 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  36.59 
 
 
394 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  34.87 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  37.56 
 
 
441 aa  221  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  34.32 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  37.05 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  35.54 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  38.15 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0631  phosphoglycerate kinase  35.84 
 
 
404 aa  220  3e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0347662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  34.31 
 
 
394 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  34.31 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  34.38 
 
 
394 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf530  phosphoglycerate kinase  34.96 
 
 
397 aa  219  6e-56  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0418919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 
395 aa  219  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  36.17 
 
 
397 aa  219  7e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  34.06 
 
 
394 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  37.96 
 
 
399 aa  219  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  34.06 
 
 
394 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  34.06 
 
 
394 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  35.89 
 
 
395 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  34.89 
 
 
392 aa  219  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  34.06 
 
 
394 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  34.06 
 
 
394 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  37.63 
 
 
401 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>