More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0577 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 		 411 aa  850    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  65.95 
 
 		 382 aa  494  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  61.92 
 
 		 409 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  59.2 
 
 		 410 aa  481  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  61.29 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  52.61 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.94 
 
 		 413 aa  423  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.37 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  51.43 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.32 
 
 		 415 aa  413  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  50.61 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  49.88 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  47.16 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  47.11 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.67 
 
 		 451 aa  301  1e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.93 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.54 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.67 
 
 		 418 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.15 
 
 		 418 aa  295  7e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.29 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.89 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.744807 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.44 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  42.04 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.36 
 
 		 417 aa  249  8e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.68 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.44 
 
 		 418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.21 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.36 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  31.66 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  30.97 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  30.72 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  30.47 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  30.47 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  30.47 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  30.06 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  31.52 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  31.4 
 
 		 339 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  30.18 
 
 		 334 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  30.92 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  29.59 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  29.59 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  29.88 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  30.47 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  32.47 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  29.97 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  30.38 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  30.66 
 
 		 338 aa  127  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  30.09 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  25.96 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  29.22 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  28.53 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  25.28 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05280  L-asparaginase type I family protein  30.99 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1778  L-asparaginase, type I  29.91 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285439  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002912  L-asparaginase  30.64 
 
 		 337 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03045  cytoplasmic asparaginase I  30.43 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3394  cytoplasmic asparaginase I  29.48 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2265  cytoplasmic asparaginase I  30.99 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2158  cytoplasmic asparaginase I  28.78 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  30.21 
 
 		 336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  30.21 
 
 		 336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1580  cytoplasmic asparaginase I  30.52 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  30.68 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1722  cytoplasmic asparaginase I  30.79 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0150989  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  27.75 
 
 		 359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5627  asparaginase  30.23 
 
 		 335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0567778  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  29.77 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1969  cytoplasmic asparaginase I  32.21 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0253632  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2347  cytoplasmic asparaginase I  31.49 
 
 		 338 aa  111  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109422  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  31.27 
 
 		 339 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2295  cytoplasmic asparaginase I  30.64 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2723  cytoplasmic asparaginase I  31.6 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  hitchhiker  0.00370317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2092  cytoplasmic asparaginase I  31.08 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1983  cytoplasmic asparaginase I  31.08 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  29.43 
 
 		 349 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  29.52 
 
 		 324 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  29.52 
 
 		 324 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  30.21 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  30.21 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  30.21 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  30.21 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2050  cytoplasmic asparaginase I  30.06 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0327097  hitchhiker  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  30.21 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  30.21 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2412  cytoplasmic asparaginase I  30.06 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031003  hitchhiker  0.000169421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  30.21 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  30.21 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  30.21 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  29.86 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2054  cytoplasmic asparaginase I  30.06 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  29.22 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  29.74 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  29.94 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  29.94 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  28.79 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2233  L-asparaginase, type I  25.66 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  31.21 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  30.24 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  29.94 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  29.12 
 
 		 337 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>