More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0491 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  61.97 
 
 
285 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  61.4 
 
 
300 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  59.86 
 
 
293 aa  355  5e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  55.99 
 
 
300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  49.47 
 
 
284 aa  295  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  49.49 
 
 
294 aa  295  6e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  48.76 
 
 
282 aa  287  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  49.31 
 
 
289 aa  280  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  48.76 
 
 
284 aa  277  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  46.53 
 
 
288 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
288 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  46.18 
 
 
306 aa  265  8e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
288 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  48.61 
 
 
288 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  45.79 
 
 
296 aa  250  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  38.25 
 
 
292 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  37.81 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  37.46 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  38.08 
 
 
294 aa  185  6e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
295 aa  179  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 
282 aa  179  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
294 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
283 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
286 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  38.01 
 
 
290 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 
282 aa  176  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  36.68 
 
 
294 aa  175  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 
304 aa  175  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.62 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  36.33 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  36.68 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
286 aa  171  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  39.36 
 
 
295 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 
282 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 
299 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 
291 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
291 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 
285 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 
289 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
299 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
283 aa  169  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
299 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 
289 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
299 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 
299 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
299 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
285 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
299 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
299 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  35.67 
 
 
298 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
294 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
299 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
299 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  36.39 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  35.99 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  35.67 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  36.39 
 
 
299 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  34.24 
 
 
299 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
299 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  35.93 
 
 
299 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
299 aa  165  8e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
299 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
299 aa  165  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
299 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
283 aa  165  8e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
299 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
299 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
299 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 
299 aa  165  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  36.39 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
298 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  34.24 
 
 
299 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
299 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  34.24 
 
 
299 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  34.41 
 
 
284 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
297 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 
297 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
324 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 
284 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
299 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
299 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
299 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
299 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 
289 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 
281 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 
286 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 
310 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  35.46 
 
 
287 aa  158  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>