34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0100 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 174 aa  353  6.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  66.67 
 
 		 175 aa  227  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  64.37 
 
 		 175 aa  223  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  61.27 
 
 		 174 aa  221  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  63.79 
 
 		 175 aa  216  8.999999999999998e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  53.76 
 
 		 174 aa  192  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  52.02 
 
 		 173 aa  183  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  51.15 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  48.28 
 
 		 205 aa  169  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  49.43 
 
 		 193 aa  167  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  49.43 
 
 		 193 aa  167  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  51.32 
 
 		 207 aa  167  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  49.4 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  51.66 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  46.55 
 
 		 193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  50.33 
 
 		 196 aa  158  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  48.39 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  48.39 
 
 		 186 aa  157  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  50 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  43.41 
 
 		 182 aa  150  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  47.1 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  49.02 
 
 		 194 aa  147  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  49.68 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  45.06 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  45.81 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  47.44 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  43.87 
 
 		 195 aa  137  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  37.07 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.46 
 
 		 300 aa  105  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.46 
 
 		 300 aa  105  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  36.23 
 
 		 304 aa  105  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  35.51 
 
 		 301 aa  104  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  34.67 
 
 		 297 aa  98.6  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  33.33 
 
 		 160 aa  94.4  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>