More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0085 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  66.42 
 
 		 137 aa  200  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  64.23 
 
 		 137 aa  190  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  64.44 
 
 		 139 aa  180  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  62.04 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  50.74 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  50.36 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  49.26 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  52.34 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  41.86 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  43.41 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  41.09 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  46.67 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  41.67 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  40.88 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  40.15 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  39.86 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  39.26 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  37.96 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  39.42 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  37.04 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  40.77 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  36.5 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  41.09 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  39.71 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  39.71 
 
 		 158 aa  96.7  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  38.97 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  38.97 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  35.88 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  37.21 
 
 		 187 aa  93.6  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  37.31 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  37.24 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  32.88 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  44.62 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  38.16 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57474  predicted protein  39.19 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.576492  normal  0.012106 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  45.76 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  48.98 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  43.64 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  43.64 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  36.67 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  39.44 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  46.3 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0677  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.082813  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  44.62 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  43.64 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  41.94 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  42.59 
 
 		 91 aa  48.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0287  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0589679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  41.07 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  43.75 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  42.59 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  38.81 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  48 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  44.9 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  43.4 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  33.8 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  41.07 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  42.59 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  44.9 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  44.9 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  41.07 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  43.64 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0498  30S ribosomal protein S19  44.44 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000587153  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  41.82 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2165  ribosomal protein S19  41.67 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00915684  normal  0.130063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  41.67 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  37.68 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  38.89 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  37.74 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  44.9 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  40 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  40.54 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  0.00000111628 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0437  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00413401  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  38.18 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  41.54 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  43.4 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>