194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1906 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  60.85 
 
 
686 aa  877  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  61.95 
 
 
676 aa  878  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  61.83 
 
 
679 aa  880  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  66.82 
 
 
678 aa  945  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  61.28 
 
 
694 aa  892  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  100 
 
 
687 aa  1406  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  44.87 
 
 
676 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  44.14 
 
 
679 aa  586  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  44.43 
 
 
676 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  43.52 
 
 
684 aa  572  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  43.95 
 
 
678 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  39.14 
 
 
684 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  39.12 
 
 
681 aa  488  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  39.59 
 
 
682 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  4.32292e-07 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  40.03 
 
 
682 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  5.8517e-05 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  37.87 
 
 
681 aa  478  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  49.16 
 
 
686 aa  468  1e-130  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  48.74 
 
 
689 aa  468  1e-130  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  37.57 
 
 
682 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  45.17 
 
 
670 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  47.75 
 
 
703 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  48.38 
 
 
694 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  46.04 
 
 
675 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  34.37 
 
 
531 aa  263  7e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  34.97 
 
 
508 aa  262  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  34.76 
 
 
470 aa  244  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  32.49 
 
 
469 aa  239  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  30.16 
 
 
477 aa  211  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  28.89 
 
 
473 aa  181  5e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  26.33 
 
 
485 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  28.25 
 
 
485 aa  153  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  30.36 
 
 
186 aa  79  3e-13  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  26.18 
 
 
793 aa  62  4e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  31.29 
 
 
798 aa  57.4  8e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  29.94 
 
 
809 aa  57  1e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  26.9 
 
 
806 aa  55.8  2e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  27.91 
 
 
809 aa  56.2  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  30.41 
 
 
820 aa  56.6  2e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  28.4 
 
 
821 aa  55.8  2e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  26.9 
 
 
806 aa  56.2  2e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  28.9 
 
 
808 aa  55.5  3e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  28.74 
 
 
816 aa  55.1  5e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  29.76 
 
 
810 aa  54.7  5e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  25.51 
 
 
804 aa  54.7  6e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
778 aa  54.3  8e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  26.87 
 
 
798 aa  53.9  9e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  27.54 
 
 
804 aa  53.9  9e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  26.55 
 
 
805 aa  53.9  9e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  25.91 
 
 
785 aa  53.5  1e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  26.51 
 
 
804 aa  53.9  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  9.30171e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 
815 aa  53.5  1e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  1.46786e-05 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  29.76 
 
 
812 aa  53.5  1e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  28.99 
 
 
785 aa  53.1  2e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  27.81 
 
 
785 aa  53.1  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.02601e-05  hitchhiker  7.06703e-06 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  28 
 
 
813 aa  53.1  2e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  26.2 
 
 
798 aa  52.8  2e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  25.99 
 
 
797 aa  53.1  2e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  26.2 
 
 
798 aa  52.8  2e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  23.96 
 
 
786 aa  52.8  2e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.93183e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  26.43 
 
 
798 aa  53.1  2e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  23.62 
 
 
785 aa  52.8  2e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  31.87 
 
 
812 aa  52.8  2e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  25.66 
 
 
856 aa  53.1  2e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  26.53 
 
 
785 aa  52.4  3e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.48642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  27.61 
 
 
821 aa  52.4  3e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  23.23 
 
 
785 aa  52.4  3e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.41636e-06  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  23.61 
 
 
826 aa  52.4  3e-05  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.46 
 
 
787 aa  52.4  3e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  23.23 
 
 
784 aa  52.4  3e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  9.76039e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 
807 aa  52  3e-05  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  28.24 
 
 
810 aa  52  3e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  26.88 
 
 
797 aa  51.6  4e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  27.63 
 
 
798 aa  51.6  5e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  27.81 
 
 
809 aa  51.2  6e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.46 
 
 
793 aa  51.2  6e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  26 
 
 
811 aa  51.2  6e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.46 
 
 
793 aa  51.2  6e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  28.9 
 
 
805 aa  51.2  6e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  23.23 
 
 
785 aa  51.2  7e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  28.77 
 
 
802 aa  50.8  7e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  22.83 
 
 
785 aa  50.8  8e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.14531e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  22.83 
 
 
785 aa  50.8  8e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.60323e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  22.83 
 
 
785 aa  50.8  8e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.03769e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  23.23 
 
 
785 aa  50.8  9e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.73516e-06  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  27.22 
 
 
781 aa  50.8  9e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.52333e-05  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  23.23 
 
 
785 aa  50.4  9e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.7236e-06  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  28.41 
 
 
819 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  28.85 
 
 
820 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  29.5 
 
 
774 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.12252e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.46 
 
 
786 aa  50.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  28 
 
 
813 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  27.22 
 
 
805 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0390  ATP-dependent protease La  24.54 
 
 
800 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.754053  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  26 
 
 
803 aa  50.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0201  ATP-dependent protease La  25.99 
 
 
815 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  29.5 
 
 
775 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  25.78 
 
 
811 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  1.89689e-08 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  28.48 
 
 
813 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  25.71 
 
 
802 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  25.78 
 
 
796 aa  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>