239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5029 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
61 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  1.28267e-05  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  98.31 
 
 
59 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  80 
 
 
65 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.07725e-06  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1062  50S ribosomal protein L30  95.92 
 
 
59 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000861748  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1033  50S ribosomal protein L30  93.88 
 
 
61 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  4.15927e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1050  50S ribosomal protein L30  93.88 
 
 
61 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0317363  normal  0.122599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  70.49 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  71.19 
 
 
59 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  73.33 
 
 
60 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  68.33 
 
 
60 aa  80.5  8e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  2.84143e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  66.1 
 
 
60 aa  79.3  2e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  60 
 
 
60 aa  74.3  5e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  54.24 
 
 
60 aa  73.9  6e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  59.02 
 
 
61 aa  73.9  6e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  60 
 
 
60 aa  73.9  7e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  59.32 
 
 
60 aa  73.2  1e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  58.33 
 
 
60 aa  72.8  1e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  60.66 
 
 
61 aa  73.6  1e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  61.02 
 
 
60 aa  72.4  2e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 
62 aa  71.6  3e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  55.93 
 
 
60 aa  71.2  5e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  55 
 
 
60 aa  70.9  6e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 
60 aa  70.9  6e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  55 
 
 
60 aa  70.5  8e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 
65 aa  69.3  2e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  55.93 
 
 
59 aa  68.9  2e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  52.54 
 
 
60 aa  67.4  6e-11  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 
60 aa  67  8e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 
61 aa  67  9e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 
61 aa  66.6  1e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 
60 aa  66.2  1e-10  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  56.67 
 
 
61 aa  66.6  1e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  50.85 
 
 
60 aa  65.9  2e-10  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  55.74 
 
 
61 aa  65.9  2e-10  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 
60 aa  65.5  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  57.63 
 
 
61 aa  65.1  3e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1141  ribosomal protein L30  55.93 
 
 
67 aa  65.1  3e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.529136  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2670  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
68 aa  65.5  3e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2958  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 
68 aa  64.7  4e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  55.93 
 
 
66 aa  64.3  6e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
60 aa  63.5  8e-10  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.19229e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  63.5  9e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
60 aa  63.2  1e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  52.63 
 
 
59 aa  62  2e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 
61 aa  62.8  2e-09  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 
63 aa  60.5  8e-09  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 
61 aa  59.7  1e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 
66 aa  59.3  2e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 
62 aa  58.5  3e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 
58 aa  58.5  3e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  51.67 
 
 
60 aa  58.5  3e-08  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 
58 aa  58.5  3e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.99402e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  53.57 
 
 
63 aa  58.5  3e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1104  ribosomal protein L30p/L7e  59.32 
 
 
60 aa  58.2  4e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  48.28 
 
 
58 aa  58.2  4e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  8.60316e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 
61 aa  57.8  5e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  4.49635e-09  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 
62 aa  57.8  5e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  50.91 
 
 
61 aa  57.8  5e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 
60 aa  57.4  6e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  3.48111e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 
56 aa  57.4  7e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  51.79 
 
 
61 aa  57  8e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 
56 aa  57  8e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 
59 aa  57  9e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 
59 aa  57  9e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16990  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
74 aa  57  9e-08  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  4.9489e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  47.46 
 
 
60 aa  56.2  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  51.67 
 
 
60 aa  56.2  1e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 
59 aa  56.2  1e-07  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  50.91 
 
 
60 aa  56.6  1e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  43.86 
 
 
60 aa  56.2  1e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 
61 aa  56.6  1e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 
62 aa  55.8  2e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  45 
 
 
75 aa  56.2  2e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  6.50866e-05 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 
60 aa  55.8  2e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.01439e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  45.61 
 
 
58 aa  55.5  2e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  7.5211e-08 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 
67 aa  55.1  3e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
60 aa  55.5  3e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 
67 aa  55.1  3e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  9.88415e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  52.73 
 
 
64 aa  55.1  4e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  5.65029e-06 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
65 aa  54.3  6e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 
60 aa  53.9  8e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 
62 aa  53.5  9e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.87774e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
59 aa  53.1  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  44.44 
 
 
58 aa  53.1  1e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 
61 aa  53.1  1e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  6.57277e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 
59 aa  53.1  1e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 
59 aa  52.8  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.0093e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  44.07 
 
 
59 aa  53.1  1e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  8.36724e-05  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  46.43 
 
 
61 aa  52.4  2e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  43.64 
 
 
61 aa  52.8  2e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
59 aa  52.4  2e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  44.83 
 
 
62 aa  52.8  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  47.46 
 
 
59 aa  52  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 
60 aa  52.4  2e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 
59 aa  52.4  2e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
59 aa  52.8  2e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  52.4  2e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.91615e-05  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
59 aa  52.8  2e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  45.45 
 
 
60 aa  52.4  2e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.04117e-05  unclonable  8.20737e-09 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  47.27 
 
 
61 aa  52.4  2e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>