More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2155 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  87.03 
 
 
406 aa  699  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  86.78 
 
 
406 aa  698  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  88.11 
 
 
390 aa  643  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  100 
 
 
418 aa  820  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  87.03 
 
 
406 aa  699  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  78.01 
 
 
395 aa  572  1e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  68.78 
 
 
397 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  70.65 
 
 
398 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  58.5 
 
 
406 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  55.08 
 
 
407 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  55.17 
 
 
403 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  55.13 
 
 
398 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  56.28 
 
 
399 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  48.85 
 
 
401 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  48.82 
 
 
397 aa  283  6e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  44.39 
 
 
405 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  45.12 
 
 
414 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  46.63 
 
 
398 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1828  major facilitator superfamily MFS_1  47.68 
 
 
412 aa  246  5e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2807  major facilitator superfamily MFS_1  47.08 
 
 
418 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.297836  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 
395 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  31.05 
 
 
389 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  31.32 
 
 
389 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  31.22 
 
 
389 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  31.22 
 
 
389 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  31.22 
 
 
389 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  31.22 
 
 
389 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  31.22 
 
 
389 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  31.22 
 
 
389 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  31.22 
 
 
389 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  31.59 
 
 
389 aa  173  4e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  33.85 
 
 
423 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  34.05 
 
 
404 aa  169  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  34.07 
 
 
403 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51581e-09 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  36.09 
 
 
411 aa  165  1e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  36.09 
 
 
403 aa  165  1e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  33.98 
 
 
403 aa  165  1e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 
404 aa  166  1e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  32.33 
 
 
403 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  39.24 
 
 
394 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  33.24 
 
 
403 aa  163  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  31.14 
 
 
389 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  31.14 
 
 
389 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  37.19 
 
 
403 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  32.42 
 
 
403 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  30.17 
 
 
905 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  33.24 
 
 
406 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  29.88 
 
 
895 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  29.57 
 
 
912 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  34.53 
 
 
403 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  32.56 
 
 
402 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  34.58 
 
 
404 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  29.2 
 
 
441 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  35.91 
 
 
403 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  29.55 
 
 
387 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  35.46 
 
 
403 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
420 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  33.42 
 
 
422 aa  149  1e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  34.81 
 
 
403 aa  148  2e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
417 aa  148  2e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  34.23 
 
 
411 aa  147  4e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 
382 aa  147  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  31.64 
 
 
409 aa  146  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  35.59 
 
 
421 aa  146  8e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  35.4 
 
 
414 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  28.75 
 
 
418 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  28.71 
 
 
426 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  28.71 
 
 
426 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  36.02 
 
 
421 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  28.85 
 
 
426 aa  140  4e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  29.64 
 
 
428 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
435 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  29.27 
 
 
418 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  33.09 
 
 
424 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 
435 aa  136  6e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  28.84 
 
 
440 aa  136  7e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  32.85 
 
 
424 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  33.11 
 
 
453 aa  135  1e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 
460 aa  135  1e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
428 aa  135  1e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  32.85 
 
 
424 aa  135  1e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  32.36 
 
 
424 aa  135  1e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  28.47 
 
 
420 aa  135  2e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
443 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  27.07 
 
 
436 aa  134  4e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
438 aa  134  4e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
438 aa  134  4e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  33.45 
 
 
431 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  30.49 
 
 
425 aa  133  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  33.57 
 
 
431 aa  132  2e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  29.02 
 
 
437 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  32.3 
 
 
459 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  27.76 
 
 
431 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  31.49 
 
 
893 aa  129  8e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  31.61 
 
 
917 aa  129  1e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  31.12 
 
 
424 aa  129  1e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  27.89 
 
 
417 aa  128  2e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  27.88 
 
 
424 aa  128  2e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  31.64 
 
 
426 aa  128  2e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  29.89 
 
 
422 aa  128  2e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>