More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1755 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  84.86 
 
 
185 aa  327  5.0000000000000004e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  84.86 
 
 
185 aa  325  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  81.52 
 
 
185 aa  307  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  81.52 
 
 
185 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  80.43 
 
 
185 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  80.98 
 
 
185 aa  303  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  80.98 
 
 
185 aa  303  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  80.98 
 
 
185 aa  303  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  80.98 
 
 
185 aa  303  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  80.98 
 
 
185 aa  303  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  79.89 
 
 
185 aa  303  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  80.98 
 
 
185 aa  303  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  80.98 
 
 
185 aa  303  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  79.89 
 
 
185 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  80.43 
 
 
185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  80.43 
 
 
185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  79.35 
 
 
185 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  78.8 
 
 
186 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  77.72 
 
 
185 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  77.72 
 
 
185 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  77.72 
 
 
185 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  77.17 
 
 
186 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  77.72 
 
 
186 aa  293  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  77.72 
 
 
186 aa  291  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  75 
 
 
188 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  73.91 
 
 
184 aa  285  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  73.91 
 
 
184 aa  285  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  73.91 
 
 
184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  72.83 
 
 
186 aa  280  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  69.02 
 
 
184 aa  279  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  70.65 
 
 
199 aa  279  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  72.28 
 
 
184 aa  278  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  73.37 
 
 
184 aa  276  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  71.74 
 
 
184 aa  276  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  69.52 
 
 
188 aa  275  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  69.57 
 
 
184 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  69.02 
 
 
184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  69.02 
 
 
184 aa  270  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  67.38 
 
 
188 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  67.38 
 
 
188 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  66.49 
 
 
189 aa  263  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  63.78 
 
 
186 aa  248  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  62.03 
 
 
188 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  61.83 
 
 
186 aa  244  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  62.37 
 
 
186 aa  243  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  61.08 
 
 
186 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  61.29 
 
 
186 aa  241  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  66.14 
 
 
191 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  66.14 
 
 
191 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  60.54 
 
 
186 aa  238  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  61.29 
 
 
186 aa  228  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  61.29 
 
 
186 aa  227  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  61.29 
 
 
186 aa  227  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  61.29 
 
 
186 aa  227  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  60.22 
 
 
186 aa  227  9e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  60.22 
 
 
186 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  60.22 
 
 
186 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  60.22 
 
 
186 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  60.22 
 
 
186 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  60.22 
 
 
186 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  57.75 
 
 
190 aa  221  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  53.44 
 
 
189 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  52.38 
 
 
189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  52.38 
 
 
189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  53.76 
 
 
189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  50.53 
 
 
189 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  50.53 
 
 
189 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  50 
 
 
189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  50 
 
 
189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  45.74 
 
 
190 aa  164  8e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  42.55 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  39.46 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  37.84 
 
 
187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  40.32 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  37.1 
 
 
187 aa  131  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  35.33 
 
 
185 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  38.38 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  36.56 
 
 
187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  37.1 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  37.5 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  36.96 
 
 
185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  36.02 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  34.97 
 
 
188 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  34.78 
 
 
188 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  36.76 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  36.56 
 
 
187 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  34.78 
 
 
185 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  35.52 
 
 
189 aa  124  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  35.33 
 
 
186 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  36.31 
 
 
190 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  34.78 
 
 
188 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  36.31 
 
 
190 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  36.31 
 
 
190 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  34.05 
 
 
187 aa  124  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  36.41 
 
 
185 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>