33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1311 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  99.18 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  90.12 
 
 		 243 aa  421  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  90.12 
 
 		 243 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  85.6 
 
 		 291 aa  410  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  84.77 
 
 		 243 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  49.17 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5179  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  48.29 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.81445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  32.48 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  35.02 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  28.4 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  26.64 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  29.34 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  28.5 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  27.14 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2031  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  29.29 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  28.21 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  30.73 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  27.23 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  28.48 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  30.08 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1251  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  24.9 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0617  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  27.6 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  31 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0059  hypothetical protein  23.26 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  31 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3253  hypothetical protein  31 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0361547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  29 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>